103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0339 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  100 
 
 
398 aa  829    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  44.35 
 
 
376 aa  282  8.000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
1140 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
1140 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
1140 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  32.43 
 
 
390 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
1129 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  31.73 
 
 
376 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0231  glycoside hydrolase family 8  28.99 
 
 
429 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1167  cellulase  30.96 
 
 
337 aa  99.8  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.314141  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  28.76 
 
 
332 aa  96.7  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  29.92 
 
 
366 aa  96.3  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  30.21 
 
 
337 aa  95.9  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  27.59 
 
 
332 aa  94.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5210  cellulase  29.22 
 
 
344 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558539  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  29.58 
 
 
1152 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  28.1 
 
 
477 aa  88.2  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  27.98 
 
 
453 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2637  endo-1,4-D-glucanase  31.5 
 
 
370 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  27.98 
 
 
453 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  27.98 
 
 
453 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  26.67 
 
 
330 aa  87  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2421  chitosanase  27.98 
 
 
453 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00349071  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1925  endo-1,4-D-glucanase  32.9 
 
 
414 aa  86.3  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.029857 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2138  endo-1,4-D-glucanase  32.31 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2695  chitosanase  27.57 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.855226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  27.57 
 
 
453 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1259  endo-1,4-D-glucanase  32.89 
 
 
406 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0277614  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1292  endo-1,4-D-glucanase  32.47 
 
 
406 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0452609  normal  0.0578777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3714  licheninase  25 
 
 
417 aa  83.2  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4526  endo-1,4-D-glucanase  34.63 
 
 
409 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00393653  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0898  endo-1,4-D-glucanase  31.6 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000507081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1380  endo-1,4-D-glucanase  31.6 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532451  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3195  endo-1,4-D-glucanase  30.77 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520349  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1358  endo-1,4-D-glucanase  31.6 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0962234  normal  0.162374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3928  endo-1,4-D-glucanase  30.34 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  28.19 
 
 
465 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3254  endo-1,4-D-glucanase  27.41 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2042  endo-1,4-D-glucanase  31.06 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361945  normal  0.401714 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2378  endo-1,4-D-glucanase  26.32 
 
 
388 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5838  endo-1,4-D-glucanase  32.2 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.35562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2251  endo-1,4-D-glucanase  28.78 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  25.9 
 
 
463 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4175  hypothetical protein  25.86 
 
 
362 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2071  endo-1,4-D-glucanase  30.89 
 
 
379 aa  77  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124631 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3526  endo-1,4-D-glucanase  30.17 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  30.25 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3889  endo-1,4-D-glucanase  27.72 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0074  endo-1,4-D-glucanase  37.14 
 
 
371 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0150  endo-1,4-D-glucanase  35 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  27.24 
 
 
609 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0182  Cellulase  27.8 
 
 
368 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3812  endo-1,4-D-glucanase  27.72 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.370483 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03379  endo-1,4-D-glucanase  28.22 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0186  endo-1,4-D-glucanase  28.22 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3840  endo-1,4-D-glucanase  28.22 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.634821 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3937  endo-1,4-D-glucanase  27.8 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0936967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4896  endo-1,4-D-glucanase  28.22 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03332  hypothetical protein  28.22 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3933  endo-1,4-D-glucanase  27.34 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3825  endo-1,4-D-glucanase  27.34 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1561  glycoside hydrolase family protein  23.67 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4019  endo-1,4-D-glucanase  27.8 
 
 
365 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3993  endo-1,4-D-glucanase  27.34 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.985148  normal  0.495711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  28.51 
 
 
429 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  27.66 
 
 
460 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2145  endo-1,4-D-glucanase  28.4 
 
 
520 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246354  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  25.88 
 
 
511 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  28.51 
 
 
419 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  28.51 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0071  endo-1,4-D-glucanase  35.71 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1029  endoglucanase  29.17 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2231  endo-1,4-D-glucanase  28.4 
 
 
506 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161113  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  28.75 
 
 
468 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0632  endo-1,4-D-glucanase  28.4 
 
 
506 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.585544  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1976  cellulase  27.04 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65444  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0964  cellulase  26.38 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1589  endo-1,4-D-glucanase  28.4 
 
 
514 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390235  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0686  endo-1,4-D-glucanase  28.4 
 
 
437 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  24.69 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2008  endo-1,4-D-glucanase  28.4 
 
 
508 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4797  cellulase  31.65 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  28.81 
 
 
421 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0331  hypothetical protein  27.04 
 
 
612 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378113  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4070  endo-1,4-D-glucanase  30 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0093  endo-1,4-D-glucanase  30 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0792  endo-1,4-D-glucanase  30.26 
 
 
493 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0105  cellulase  32.91 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535219  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  28.27 
 
 
385 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  24.39 
 
 
543 aa  63.2  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0570  endo-1,4-D-glucanase  32.81 
 
 
376 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  25.88 
 
 
477 aa  57.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  25.31 
 
 
432 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  23.15 
 
 
430 aa  56.2  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  27.35 
 
 
1223 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  24.37 
 
 
445 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  25.19 
 
 
571 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0082  endoglucanase Y  24.1 
 
 
372 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532728  normal  0.916342 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4314  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 
412 aa  47  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  23.39 
 
 
912 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>