108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0993 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0993  cellulase  100 
 
 		 376 aa  761    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  44.35 
 
 		 398 aa  301  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  36.1 
 
 		 1140 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  36.05 
 
 		 1140 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  35 
 
 		 1129 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  38.96 
 
 		 390 aa  129  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  34.82 
 
 		 1140 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  36.1 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1292  endo-1,4-D-glucanase  37.83 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0452609  normal  0.0578777 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1259  endo-1,4-D-glucanase  38.16 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0277614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  29.89 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4526  endo-1,4-D-glucanase  37.46 
 
 		 409 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00393653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  29.87 
 
 		 330 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  29.92 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  28.44 
 
 		 477 aa  99.8  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1925  endo-1,4-D-glucanase  37.82 
 
 		 414 aa  99.8  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029857 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3928  endo-1,4-D-glucanase  31.38 
 
 		 360 aa  99.4  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0898  endo-1,4-D-glucanase  36.09 
 
 		 409 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000507081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1380  endo-1,4-D-glucanase  36.09 
 
 		 409 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532451  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1358  endo-1,4-D-glucanase  36.09 
 
 		 409 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0962234  normal  0.162374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  35.74 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0182  Cellulase  29.69 
 
 		 368 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4019  endo-1,4-D-glucanase  29.69 
 
 		 365 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0186  endo-1,4-D-glucanase  29.69 
 
 		 368 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3937  endo-1,4-D-glucanase  29.69 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0936967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4896  endo-1,4-D-glucanase  30 
 
 		 370 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  30.4 
 
 		 332 aa  97.4  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03379  endo-1,4-D-glucanase  29.69 
 
 		 368 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  31.28 
 
 		 332 aa  97.1  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03332  hypothetical protein  29.69 
 
 		 368 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3840  endo-1,4-D-glucanase  30 
 
 		 370 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.634821 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5838  endo-1,4-D-glucanase  31.72 
 
 		 393 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.35562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0105  cellulase  33.6 
 
 		 393 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535219  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0792  endo-1,4-D-glucanase  33.63 
 
 		 493 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127237  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  34.63 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2042  endo-1,4-D-glucanase  35.24 
 
 		 393 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361945  normal  0.401714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  30.12 
 
 		 465 aa  94.4  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  34.45 
 
 		 429 aa  94  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3993  endo-1,4-D-glucanase  31.85 
 
 		 369 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.985148  normal  0.495711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3889  endo-1,4-D-glucanase  31.85 
 
 		 369 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  34.31 
 
 		 419 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3933  endo-1,4-D-glucanase  31.85 
 
 		 369 aa  92.8  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3812  endo-1,4-D-glucanase  31.85 
 
 		 369 aa  92.8  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.370483 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3825  endo-1,4-D-glucanase  31.85 
 
 		 369 aa  92.8  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0686  endo-1,4-D-glucanase  32.94 
 
 		 437 aa  92.8  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0632  endo-1,4-D-glucanase  33.71 
 
 		 506 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.585544  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2231  endo-1,4-D-glucanase  34.41 
 
 		 506 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161113  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2145  endo-1,4-D-glucanase  34.41 
 
 		 520 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246354  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1589  endo-1,4-D-glucanase  33.43 
 
 		 514 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390235  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2008  endo-1,4-D-glucanase  32.94 
 
 		 508 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0964  cellulase  32.77 
 
 		 356 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5210  cellulase  32.35 
 
 		 344 aa  90.1  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558539  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  26.69 
 
 		 453 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  26.69 
 
 		 453 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0231  glycoside hydrolase family 8  28.36 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  28.52 
 
 		 1152 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  27.09 
 
 		 453 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  33.89 
 
 		 384 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  25.2 
 
 		 453 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0071  endo-1,4-D-glucanase  33.2 
 
 		 371 aa  87  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1976  cellulase  33.19 
 
 		 356 aa  86.7  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65444  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2695  chitosanase  24.8 
 
 		 453 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.855226  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  26.49 
 
 		 460 aa  86.7  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2421  chitosanase  26.29 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00349071  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3254  endo-1,4-D-glucanase  34.29 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0074  endo-1,4-D-glucanase  32.14 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2378  endo-1,4-D-glucanase  33.78 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2138  endo-1,4-D-glucanase  33.33 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  28.57 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0150  endo-1,4-D-glucanase  32.3 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3195  endo-1,4-D-glucanase  32.95 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  30.64 
 
 		 468 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0331  hypothetical protein  33.19 
 
 		 612 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378113  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2637  endo-1,4-D-glucanase  33.71 
 
 		 370 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4797  cellulase  30.52 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2251  endo-1,4-D-glucanase  33.92 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  30 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  24.81 
 
 		 463 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3526  endo-1,4-D-glucanase  32.2 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1167  cellulase  28.21 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.314141  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2071  endo-1,4-D-glucanase  31.52 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124631 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4175  hypothetical protein  29.91 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4070  endo-1,4-D-glucanase  30.73 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0093  endo-1,4-D-glucanase  30.73 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0570  endo-1,4-D-glucanase  33.17 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3714  licheninase  27.59 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  27.56 
 
 		 609 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1029  endoglucanase  28.61 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  22.3 
 
 		 912 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1561  glycoside hydrolase family protein  27.11 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  24.59 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  27.08 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  24.4 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  28.86 
 
 		 543 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0082  endoglucanase Y  29.95 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532728  normal  0.916342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  27.11 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  24.62 
 
 		 1223 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2263  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.374897  normal  0.190888 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2684  glycoside hydrolase family protein  26.46 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>