81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2378 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2378  endo-1,4-D-glucanase  100 
 
 		 388 aa  796    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0150  endo-1,4-D-glucanase  39.4 
 
 		 370 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1029  endoglucanase  37.89 
 
 		 403 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3840  endo-1,4-D-glucanase  36.46 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.634821 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0186  endo-1,4-D-glucanase  36.74 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4019  endo-1,4-D-glucanase  36.46 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3933  endo-1,4-D-glucanase  37.4 
 
 		 369 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3825  endo-1,4-D-glucanase  37.4 
 
 		 369 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4896  endo-1,4-D-glucanase  36.46 
 
 		 370 aa  244  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3812  endo-1,4-D-glucanase  37.4 
 
 		 369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.370483 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03379  endo-1,4-D-glucanase  36.19 
 
 		 368 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03332  hypothetical protein  36.19 
 
 		 368 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3889  endo-1,4-D-glucanase  37.4 
 
 		 369 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3937  endo-1,4-D-glucanase  36.19 
 
 		 365 aa  242  7e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0936967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3993  endo-1,4-D-glucanase  37.12 
 
 		 369 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.985148  normal  0.495711 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0093  endo-1,4-D-glucanase  38.29 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4070  endo-1,4-D-glucanase  38.29 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0182  Cellulase  35.91 
 
 		 368 aa  240  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3928  endo-1,4-D-glucanase  38.04 
 
 		 360 aa  239  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0074  endo-1,4-D-glucanase  38.61 
 
 		 371 aa  237  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2251  endo-1,4-D-glucanase  38.33 
 
 		 387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0071  endo-1,4-D-glucanase  39.34 
 
 		 371 aa  236  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2071  endo-1,4-D-glucanase  40 
 
 		 379 aa  235  8e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124631 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3526  endo-1,4-D-glucanase  38.44 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5838  endo-1,4-D-glucanase  36.29 
 
 		 393 aa  230  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.35562 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1358  endo-1,4-D-glucanase  38.51 
 
 		 409 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0962234  normal  0.162374 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1380  endo-1,4-D-glucanase  38.22 
 
 		 409 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532451  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0898  endo-1,4-D-glucanase  38.22 
 
 		 409 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000507081  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3254  endo-1,4-D-glucanase  37.1 
 
 		 410 aa  228  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1292  endo-1,4-D-glucanase  37.81 
 
 		 406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0452609  normal  0.0578777 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4526  endo-1,4-D-glucanase  37.93 
 
 		 409 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00393653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2042  endo-1,4-D-glucanase  35.77 
 
 		 393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361945  normal  0.401714 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1925  endo-1,4-D-glucanase  37.93 
 
 		 414 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029857 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3195  endo-1,4-D-glucanase  39.94 
 
 		 371 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0686  endo-1,4-D-glucanase  37.92 
 
 		 437 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1589  endo-1,4-D-glucanase  38.67 
 
 		 514 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390235  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2008  endo-1,4-D-glucanase  38.67 
 
 		 508 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1259  endo-1,4-D-glucanase  37.26 
 
 		 406 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0277614  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2145  endo-1,4-D-glucanase  37.92 
 
 		 520 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246354  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0632  endo-1,4-D-glucanase  39.09 
 
 		 506 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.585544  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0792  endo-1,4-D-glucanase  39.38 
 
 		 493 aa  222  9e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127237  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2231  endo-1,4-D-glucanase  39.09 
 
 		 506 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161113  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2138  endo-1,4-D-glucanase  39.67 
 
 		 367 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2637  endo-1,4-D-glucanase  39.67 
 
 		 370 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0570  endo-1,4-D-glucanase  34.2 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  30.83 
 
 		 421 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  31.25 
 
 		 429 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  31.25 
 
 		 419 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  30 
 
 		 384 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  27.92 
 
 		 468 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  28.83 
 
 		 332 aa  89.7  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  28.57 
 
 		 337 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0105  cellulase  29.44 
 
 		 393 aa  87  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535219  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  28.43 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  33.78 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  25.41 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4797  cellulase  27.31 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1167  cellulase  25.17 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.314141  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4175  hypothetical protein  27 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  26.32 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  25.66 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 1129 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  31.01 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  31.15 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 		 1140 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  26.67 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 		 1140 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5210  cellulase  23.88 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  24.38 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 		 1140 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  29.79 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  24.64 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1976  cellulase  25.11 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65444  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0331  hypothetical protein  25.57 
 
 		 612 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  28.74 
 
 		 571 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0964  cellulase  24.03 
 
 		 356 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1561  glycoside hydrolase family protein  29.19 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0082  endoglucanase Y  22.27 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532728  normal  0.916342 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  26.2 
 
 		 453 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  24.36 
 
 		 465 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  27.4 
 
 		 445 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>