66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2684 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2684  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 292 aa  611  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4314  glycoside hydrolase family protein  55.2 
 
 		 412 aa  281  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  46.27 
 
 		 477 aa  249  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  47.43 
 
 		 445 aa  239  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  43.75 
 
 		 1748 aa  236  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3207  glycoside hydrolase family protein  43.13 
 
 		 381 aa  206  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  40.69 
 
 		 430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  48.51 
 
 		 912 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1258  glycoside hydrolase family 8  39.77 
 
 		 376 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  38.95 
 
 		 432 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1432  endoglucanase Y  36.59 
 
 		 377 aa  143  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  30.29 
 
 		 477 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  25.74 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  26.98 
 
 		 2690 aa  63.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  24.72 
 
 		 1223 aa  62.8  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  34.78 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  26.46 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  31.03 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  34.07 
 
 		 332 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0792  endo-1,4-D-glucanase  31.3 
 
 		 493 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127237  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2231  endo-1,4-D-glucanase  31.3 
 
 		 506 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161113  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2145  endo-1,4-D-glucanase  31.3 
 
 		 520 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246354  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2008  endo-1,4-D-glucanase  31.3 
 
 		 508 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0686  endo-1,4-D-glucanase  31.3 
 
 		 437 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  30.34 
 
 		 332 aa  49.7  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0632  endo-1,4-D-glucanase  31.3 
 
 		 506 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.585544  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1589  endo-1,4-D-glucanase  31.3 
 
 		 514 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390235  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  26.42 
 
 		 1152 aa  49.3  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  25.29 
 
 		 465 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  28.21 
 
 		 376 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  27.54 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  27.64 
 
 		 421 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 1129 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0186  endo-1,4-D-glucanase  24.59 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  30.86 
 
 		 390 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1167  cellulase  25.83 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.314141  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  32.05 
 
 		 468 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  26.02 
 
 		 419 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  26.02 
 
 		 429 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3840  endo-1,4-D-glucanase  24.18 
 
 		 370 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.634821 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 		 1140 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03332  hypothetical protein  24.18 
 
 		 368 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03379  endo-1,4-D-glucanase  24.18 
 
 		 368 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4896  endo-1,4-D-glucanase  24.18 
 
 		 370 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0182  Cellulase  24.18 
 
 		 368 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1029  endoglucanase  31.46 
 
 		 403 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  27.27 
 
 		 348 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3937  endo-1,4-D-glucanase  24.18 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0936967  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3889  endo-1,4-D-glucanase  26.16 
 
 		 369 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1358  endo-1,4-D-glucanase  30.17 
 
 		 409 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0962234  normal  0.162374 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0898  endo-1,4-D-glucanase  30.17 
 
 		 409 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000507081  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1925  endo-1,4-D-glucanase  27.97 
 
 		 414 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029857 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4019  endo-1,4-D-glucanase  23.63 
 
 		 365 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0570  endo-1,4-D-glucanase  26.19 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1380  endo-1,4-D-glucanase  30.17 
 
 		 409 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0532451  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 		 1140 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  27.55 
 
 		 453 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 		 1140 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3825  endo-1,4-D-glucanase  25.58 
 
 		 369 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3933  endo-1,4-D-glucanase  25.58 
 
 		 369 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  25 
 
 		 347 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3812  endo-1,4-D-glucanase  25.58 
 
 		 369 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.370483 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3993  endo-1,4-D-glucanase  25.58 
 
 		 369 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.985148  normal  0.495711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  24.41 
 
 		 384 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1292  endo-1,4-D-glucanase  27.83 
 
 		 406 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0452609  normal  0.0578777 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1259  endo-1,4-D-glucanase  27.83 
 
 		 406 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0277614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>