61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1069 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 912 aa  1876    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  41.16 
 
 		 1748 aa  292  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4314  glycoside hydrolase family protein  39.48 
 
 		 412 aa  257  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  39.44 
 
 		 477 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3207  glycoside hydrolase family protein  34.38 
 
 		 381 aa  234  6e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1258  glycoside hydrolase family 8  36.52 
 
 		 376 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  34.58 
 
 		 445 aa  208  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  33.8 
 
 		 432 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  32.96 
 
 		 430 aa  197  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2684  glycoside hydrolase family protein  48.51 
 
 		 292 aa  189  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1432  endoglucanase Y  32.15 
 
 		 377 aa  162  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  24.72 
 
 		 1223 aa  101  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  24.92 
 
 		 460 aa  93.6  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2541  hypothetical protein  36.15 
 
 		 850 aa  78.6  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.241024  hitchhiker  0.000170859 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2687  xylanase Y  35.78 
 
 		 106 aa  74.7  0.000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  22.3 
 
 		 376 aa  70.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  24.91 
 
 		 465 aa  70.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  26.94 
 
 		 2690 aa  68.2  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2263  glycoside hydrolase family protein  25.09 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.374897  normal  0.190888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  25.97 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  37.37 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  24.66 
 
 		 1152 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3714  licheninase  23.62 
 
 		 417 aa  56.2  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.379867 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2857  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1208 aa  55.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0231  glycoside hydrolase family 8  25.71 
 
 		 429 aa  55.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  35.37 
 
 		 337 aa  54.3  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 		 1129 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  23.59 
 
 		 1140 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  21.99 
 
 		 609 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  26.49 
 
 		 1140 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0105  cellulase  27.87 
 
 		 393 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535219  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 		 1140 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  22.79 
 
 		 511 aa  52.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4797  cellulase  29.13 
 
 		 367 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1976  cellulase  26.07 
 
 		 356 aa  52.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.65444  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  33.33 
 
 		 332 aa  52.4  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  36.71 
 
 		 429 aa  52  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0331  hypothetical protein  25.73 
 
 		 612 aa  51.6  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378113  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  36.71 
 
 		 419 aa  51.6  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  36.71 
 
 		 421 aa  51.2  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2687  chitosanase  27.56 
 
 		 453 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000128394 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2421  chitosanase  27.56 
 
 		 453 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00349071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2615  chitosanase  27.11 
 
 		 453 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.978313  hitchhiker  0.00000219507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  24 
 
 		 385 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  34.07 
 
 		 468 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2673  chitosanase  27.11 
 
 		 453 aa  50.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  27.62 
 
 		 348 aa  50.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2490  chitosanase  27.11 
 
 		 453 aa  50.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.551082  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  30.77 
 
 		 543 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4861  glycoside hydrolase family protein  24.34 
 
 		 376 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.181594  normal  0.0880235 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  25.83 
 
 		 347 aa  48.9  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3254  endo-1,4-D-glucanase  32.93 
 
 		 410 aa  48.9  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0964  cellulase  23.4 
 
 		 356 aa  48.9  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2695  chitosanase  26.67 
 
 		 453 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.855226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  26.96 
 
 		 332 aa  48.5  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0086  chitosanase  23.4 
 
 		 463 aa  48.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0227  glycoside hydrolase family 8  27.08 
 
 		 390 aa  47.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  34.62 
 
 		 384 aa  47  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0339  endoglucanase Y-like  23.39 
 
 		 398 aa  45.4  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0387741  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0792  endo-1,4-D-glucanase  21.7 
 
 		 493 aa  45.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.127237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>