37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3207 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3207  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 381 aa  798    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1258  glycoside hydrolase family 8  54.62 
 
 		 376 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1298  glycoside hydrolase family 8  42.22 
 
 		 477 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000471564  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  42.49 
 
 		 1748 aa  301  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1432  endoglucanase Y  47.79 
 
 		 377 aa  300  3e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4314  glycoside hydrolase family protein  42.41 
 
 		 412 aa  300  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4315  glycoside hydrolase family protein  40.68 
 
 		 445 aa  263  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3868  glycoside hydrolase family protein  37.31 
 
 		 430 aa  248  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1409  glycoside hydrolase family 8  36.76 
 
 		 432 aa  247  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0686478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1069  glycoside hydrolase family protein  34.38 
 
 		 912 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2684  glycoside hydrolase family protein  43.13 
 
 		 292 aa  207  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0730  glycoside hydrolase family 8  25.85 
 
 		 460 aa  97.8  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59724  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  27.46 
 
 		 477 aa  90.1  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00789  endoglucanase Y  32.59 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2687  xylanase Y  32.08 
 
 		 106 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0293  glycoside hydrolase family protein  22.78 
 
 		 511 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.240918  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  27.23 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  23.38 
 
 		 1223 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  26.91 
 
 		 1152 aa  53.5  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4079  Cellulase  31.93 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3936  cellulase  31.3 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1295  Cellulase  25.62 
 
 		 348 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1206  Cellulase  25.48 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.364245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0105  cellulase  28.42 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.535219  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05060  endoglucanase  29.7 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0713497  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3891  Cellulase  30.34 
 
 		 332 aa  47.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.288537  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1569  Cellulase  29.09 
 
 		 429 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.153059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3739  glycoside hydrolase family 8  25 
 
 		 468 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1369  cellulase  29.09 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140068  normal  0.0392414 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 1140 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  22.73 
 
 		 609 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1314  Cellulase  29.09 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.67253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0273  cellulase  28.07 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4797  cellulase  28.57 
 
 		 367 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0993  cellulase  22.1 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.710198  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1358  endo-1,4-D-glucanase  24.43 
 
 		 409 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0962234  normal  0.162374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4803  Cellulase  23.6 
 
 		 385 aa  43.1  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>