54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0649 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0649  hypothetical protein  100 
 
 
809 aa  1658    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00490062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3287  hypothetical protein  65.83 
 
 
813 aa  1093    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1007  hypothetical protein  28.88 
 
 
771 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2143  hypothetical protein  28.15 
 
 
757 aa  303  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.544193  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2584  hypothetical protein  28.81 
 
 
777 aa  292  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0639598  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001078  hypothetical protein  28.18 
 
 
748 aa  278  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.259566  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1431  phosphotransferase domain-containing protein  25.19 
 
 
452 aa  65.5  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.208412  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0199  phosphoesterase PHP domain protein  24.02 
 
 
480 aa  63.9  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3141  phosphotransferase domain-containing protein  31.82 
 
 
240 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.260484  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2300  phosphotransferase domain-containing protein  26.5 
 
 
221 aa  60.8  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4106  PHP domain protein  26.27 
 
 
460 aa  60.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0789  phosphotransferase domain-containing protein  26.29 
 
 
216 aa  59.7  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2338  phosphotransferase domain-containing protein  30 
 
 
241 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.885404  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1986  PHP domain protein  25.82 
 
 
228 aa  57  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.690937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0216  phosphotransferase domain-containing protein  31.19 
 
 
225 aa  55.1  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3680  PHP domain protein  26.2 
 
 
249 aa  55.1  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1718  PHP domain protein  29.27 
 
 
407 aa  54.7  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0825  phosphotransferase domain-containing protein  22.26 
 
 
460 aa  54.3  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.360487  unclonable  0.00000000114157 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1139  PHP domain protein  25.68 
 
 
215 aa  53.5  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2007  PHP domain protein  27.48 
 
 
252 aa  53.5  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.386919  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0095  PHP domain protein  28.78 
 
 
216 aa  53.1  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.411706  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  25.52 
 
 
1514 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1432  phosphotransferase domain-containing protein  35.82 
 
 
277 aa  52.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0648  phosphotransferase domain-containing protein  28.3 
 
 
219 aa  51.6  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1753  PHP domain protein  27.07 
 
 
228 aa  51.2  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0713  phosphotransferase domain-containing protein  28.77 
 
 
219 aa  51.2  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3538  PHP domain protein  24.41 
 
 
228 aa  50.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2555  PHP domain protein  23.86 
 
 
425 aa  49.7  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.301394 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1140  hypothetical protein  31.03 
 
 
286 aa  49.3  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2553  PHP domain protein  34.33 
 
 
276 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000196897  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5406  PHP-like metal-dependent phosphoesterase  32.84 
 
 
279 aa  48.5  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272926  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2137  phosphotransferase domain-containing protein  32.84 
 
 
276 aa  48.5  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2118  phosphotransferase domain-containing protein  32.84 
 
 
279 aa  48.5  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317755 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3292  PHP domain protein  29.75 
 
 
244 aa  48.1  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2010  phosphotransferase domain-containing protein  32.84 
 
 
276 aa  48.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000228692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1580  hypothetical protein  32.84 
 
 
276 aa  48.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4076  phosphotransferase domain-containing protein  22.64 
 
 
486 aa  48.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2100  phosphotransferase domain-containing protein  32.84 
 
 
279 aa  48.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5977  PHP-like  32.84 
 
 
279 aa  48.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3849  phosphotransferase domain-containing protein  25 
 
 
497 aa  47.8  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.359036  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3529  PHP domain protein  27.37 
 
 
235 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6743  phosphoesterase PHP domain protein  23.51 
 
 
541 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4474  phosphotransferase domain-containing protein  22.19 
 
 
458 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00069148 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0352  isoleucyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 
224 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2314  PHP-like  33.01 
 
 
279 aa  47  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1674  hypothetical protein  28.79 
 
 
232 aa  46.2  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.126067  hitchhiker  0.000000275253 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_620  PHP domain protein  27.01 
 
 
219 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3405  hypothetical protein  22.47 
 
 
565 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0442965 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2121  PHP domain protein  27.69 
 
 
308 aa  46.2  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1064  PHP-like protein  27.91 
 
 
322 aa  45.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0612  PHP domain protein  28.44 
 
 
227 aa  45.8  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.138908  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4132  hypothetical protein  20.7 
 
 
482 aa  45.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2713  PHP domain protein  27.52 
 
 
221 aa  44.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1406  PHP domain-containing protein  25.3 
 
 
403 aa  44.3  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.407213  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>