47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3126 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3126  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  872    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2062  hypothetical protein  34.35 
 
 
545 aa  157  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0407  hypothetical protein  33.02 
 
 
447 aa  143  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.342739 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0424  hypothetical protein  37.93 
 
 
486 aa  137  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3530  hypothetical protein  31.86 
 
 
450 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6621  hypothetical protein  28.45 
 
 
374 aa  90.9  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.915874  normal  0.389928 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6693  hypothetical protein  33.65 
 
 
374 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.354856 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5850  hypothetical protein  28.73 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0761849  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6217  hypothetical protein  28.73 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00197395 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0411  hypothetical protein  25.62 
 
 
454 aa  86.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  26.42 
 
 
450 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03460  PQQ enzyme repeat, putative  25.93 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00631598  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4012  hypothetical protein  30.81 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3844  hypothetical protein  30.81 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3830  PQQ enzyme repeat  30.81 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.289046  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3908  PQQ enzyme repeat  30.81 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.998935 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3952  PQQ enzyme repeat  30.81 
 
 
374 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.52837  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1653  hypothetical protein  29.13 
 
 
439 aa  74.3  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0547  hypothetical protein  30.92 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22881  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08220  hypothetical protein  26.59 
 
 
399 aa  73.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.338612  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4630  hypothetical protein  30.81 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.318909 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0315  hypothetical protein  28.8 
 
 
377 aa  69.7  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.985096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0607  hypothetical protein  25.28 
 
 
481 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.469545  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1830  Thioredoxin domain protein  26.03 
 
 
597 aa  63.5  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0233  hypothetical protein  25.71 
 
 
409 aa  63.5  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1430  Thioredoxin domain protein  26.03 
 
 
597 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.823534  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1351  Thioredoxin domain protein  25 
 
 
600 aa  62.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.53588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2626  Thioredoxin domain protein  24.22 
 
 
597 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.118901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0807  hypothetical protein  25.22 
 
 
473 aa  60.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1726  hypothetical protein  26.42 
 
 
494 aa  60.1  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0361  hypothetical protein  25.98 
 
 
485 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2093  hypothetical protein  25.57 
 
 
483 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.246062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3228  hypothetical protein  25.1 
 
 
481 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3106  hypothetical protein  25.21 
 
 
351 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000218303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1823  hypothetical protein  25.45 
 
 
477 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4788  hypothetical protein  25.79 
 
 
514 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.927804  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1412  hypothetical protein  25.76 
 
 
482 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3063  hypothetical protein  25.1 
 
 
481 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0173751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2751  hypothetical protein  25.1 
 
 
481 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105427  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1822  hypothetical protein  23.51 
 
 
474 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0777  hypothetical protein  29.87 
 
 
310 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0025  kelch repeat-containing protein  26.78 
 
 
667 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3061  hypothetical protein  24.7 
 
 
481 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0484  Thioredoxin domain protein  23.93 
 
 
600 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0400  hypothetical protein  23.04 
 
 
331 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08558  hypothetical protein  22.77 
 
 
593 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.303048 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  35.71 
 
 
389 aa  43.5  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>