88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6735 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6735  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 624 aa  1230    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  34.16 
 
 		 1217 aa  94  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.06 
 
 		 1364 aa  81.3  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  31.09 
 
 		 1807 aa  73.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  30.31 
 
 		 1357 aa  72.8  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  30.42 
 
 		 1523 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  32.37 
 
 		 1901 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  27.71 
 
 		 1363 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  28.82 
 
 		 1211 aa  67.4  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  28.4 
 
 		 1236 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  27.59 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.71 
 
 		 919 aa  64.3  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  31.23 
 
 		 696 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.54 
 
 		 1652 aa  63.9  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.37 
 
 		 676 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.06 
 
 		 677 aa  61.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  29.97 
 
 		 1454 aa  60.8  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  26.15 
 
 		 1163 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  27.98 
 
 		 443 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  26.86 
 
 		 1416 aa  60.1  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  27.14 
 
 		 947 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.83 
 
 		 675 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5898  WD-40 repeat protein  28.85 
 
 		 334 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.675112 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  32.48 
 
 		 954 aa  56.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.93 
 
 		 1831 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  27.39 
 
 		 578 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0083  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.52 
 
 		 761 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.21 
 
 		 930 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  24.08 
 
 		 1878 aa  54.7  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  25.91 
 
 		 1411 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3644  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.71 
 
 		 1740 aa  54.3  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511908  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  27.09 
 
 		 1196 aa  54.3  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.88 
 
 		 664 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  31.85 
 
 		 1344 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 1221 aa  53.5  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15280  predicted protein  30.18 
 
 		 534 aa  53.1  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  29.55 
 
 		 1427 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  27.8 
 
 		 742 aa  53.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25.94 
 
 		 1188 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  27.5 
 
 		 1208 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.84 
 
 		 1004 aa  51.6  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  27.46 
 
 		 1399 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.99 
 
 		 698 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  25.25 
 
 		 728 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  24.77 
 
 		 589 aa  50.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.42 
 
 		 692 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  25.72 
 
 		 687 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  28.92 
 
 		 434 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.23 
 
 		 636 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  24.91 
 
 		 316 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  32.95 
 
 		 1183 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0562  WD-40 repeat protein  27.55 
 
 		 762 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.04 
 
 		 1557 aa  48.9  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.72 
 
 		 574 aa  48.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.62 
 
 		 1240 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 		 1039 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.76 
 
 		 608 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  26.75 
 
 		 1041 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  23.93 
 
 		 1242 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.56 
 
 		 630 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  27.47 
 
 		 344 aa  47.4  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.23 
 
 		 924 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  23.73 
 
 		 589 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.13 
 
 		 596 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  28.29 
 
 		 342 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  31.87 
 
 		 1334 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  29.35 
 
 		 1230 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  23.26 
 
 		 317 aa  45.8  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  25.22 
 
 		 1213 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  23.02 
 
 		 1443 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  29.19 
 
 		 774 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.96 
 
 		 1474 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0384  WD-40 repeat-containing protein  22.43 
 
 		 423 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.59 
 
 		 1823 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.55 
 
 		 1481 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.08 
 
 		 943 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10058  ribosome biogenesis protein Rsa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01990)  29.31 
 
 		 518 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00160537  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  26.74 
 
 		 564 aa  44.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.77 
 
 		 334 aa  44.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  22.61 
 
 		 1188 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  24.08 
 
 		 778 aa  44.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  35 
 
 		 461 aa  44.3  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.25 
 
 		 733 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  27.96 
 
 		 1190 aa  44.3  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.65 
 
 		 842 aa  43.9  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.31 
 
 		 1262 aa  43.9  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05450  conserved hypothetical protein  26.39 
 
 		 523 aa  43.9  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.723357  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  30.07 
 
 		 1484 aa  43.9  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>