52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0156 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0156  Ricin B lectin  100 
 
 		 187 aa  381  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151088  normal  0.0518201 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1731  Ricin B lectin  46.31 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  29.05 
 
 		 427 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  29.12 
 
 		 482 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  34.51 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  36.54 
 
 		 487 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30 
 
 		 507 aa  57  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  26.53 
 
 		 494 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  23.19 
 
 		 476 aa  54.7  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  28.57 
 
 		 368 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  28.57 
 
 		 507 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  25.71 
 
 		 503 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  28.67 
 
 		 672 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  28.1 
 
 		 644 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  29.49 
 
 		 1000 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  25.52 
 
 		 642 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  27.54 
 
 		 806 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  27.11 
 
 		 806 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  27.54 
 
 		 806 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  27.54 
 
 		 806 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  27.54 
 
 		 806 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  28.83 
 
 		 412 aa  52  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  27.11 
 
 		 806 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  27.11 
 
 		 806 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  27.74 
 
 		 806 aa  51.2  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  26.32 
 
 		 789 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  26.62 
 
 		 1016 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  28.78 
 
 		 571 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  26.28 
 
 		 1567 aa  48.9  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  28.03 
 
 		 794 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  29.13 
 
 		 1222 aa  48.5  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  27.14 
 
 		 618 aa  47.8  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6475  Ricin B lectin  25.28 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  25.71 
 
 		 514 aa  46.2  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  26.81 
 
 		 963 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  27.86 
 
 		 465 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  27.81 
 
 		 576 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  24.14 
 
 		 411 aa  45.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  26.28 
 
 		 569 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  26.67 
 
 		 275 aa  45.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  25.64 
 
 		 497 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  25 
 
 		 943 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4177  Pectate lyase  30.34 
 
 		 430 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  27.03 
 
 		 1100 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  24.29 
 
 		 491 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  29.9 
 
 		 436 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  29.55 
 
 		 468 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  29.93 
 
 		 771 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  25.86 
 
 		 982 aa  42  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4828  Ricin B lectin  26.25 
 
 		 555 aa  41.6  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000773759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  22.56 
 
 		 240 aa  41.6  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  30 
 
 		 582 aa  41.2  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>