51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1212 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1212  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  361  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  0.337815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  36.29 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  33.59 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  32.52 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  30.77 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  31.5 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  32.8 
 
 		 1207 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  31.2 
 
 		 373 aa  61.6  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  30.28 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  33.6 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  34.68 
 
 		 548 aa  58.2  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  27.39 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  30.47 
 
 		 497 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  33.59 
 
 		 461 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  30.89 
 
 		 803 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 634 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  29.69 
 
 		 516 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  31.2 
 
 		 368 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  32.26 
 
 		 801 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  28.76 
 
 		 890 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  33.07 
 
 		 451 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.45 
 
 		 489 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  30.65 
 
 		 558 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  32.26 
 
 		 479 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.77 
 
 		 1072 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  29.13 
 
 		 627 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  34.96 
 
 		 568 aa  51.2  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  29.23 
 
 		 498 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  27.91 
 
 		 384 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  29.37 
 
 		 493 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  30.16 
 
 		 423 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.54 
 
 		 933 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  35.94 
 
 		 1128 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  29.92 
 
 		 472 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 709 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  27.33 
 
 		 801 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  27.78 
 
 		 589 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 358 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  30.3 
 
 		 391 aa  47.8  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  29.03 
 
 		 603 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  27.48 
 
 		 500 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  28.35 
 
 		 535 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  28.77 
 
 		 1567 aa  46.2  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  29.13 
 
 		 490 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  29.03 
 
 		 446 aa  44.3  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  27.2 
 
 		 465 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  37.5 
 
 		 732 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  29.13 
 
 		 801 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  31.17 
 
 		 547 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  29.17 
 
 		 522 aa  40.8  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  30.65 
 
 		 597 aa  40.8  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>