86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0316 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0323  glycoside hydrolase family 10  97.89 
 
 		 521 aa  1061    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0316  glycoside hydrolase family 10  100 
 
 		 521 aa  1082    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3847  glycoside hydrolase family 10  26.57 
 
 		 490 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01610  beta-1,4-xylanase  28.14 
 
 		 415 aa  107  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3662  glycoside hydrolase family protein  27.04 
 
 		 451 aa  104  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132636  normal  0.859273 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0012  glycoside hydrolase family 10  29.43 
 
 		 417 aa  103  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1433  glycoside hydrolase family 10  28.2 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.43821  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20470  beta-1,4-xylanase  24.56 
 
 		 399 aa  94.4  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.739929 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2048  glycoside hydrolase family 10  27.99 
 
 		 433 aa  94  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.900928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2724  glycoside hydrolase family 10  23.01 
 
 		 408 aa  88.6  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.85294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0153  glycoside hydrolase family 10  25.14 
 
 		 428 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  24.48 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  24.5 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  23.73 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  26.58 
 
 		 333 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  23.65 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  23.69 
 
 		 815 aa  72  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  25.62 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3704  glycoside hydrolase family protein  22.52 
 
 		 417 aa  69.7  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  24.67 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2105  xylanase  22.92 
 
 		 674 aa  66.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  23.86 
 
 		 1001 aa  65.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  21.46 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  22.18 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  23.59 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  21.33 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  22.22 
 
 		 820 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  22.22 
 
 		 756 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  23.47 
 
 		 323 aa  63.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  21.81 
 
 		 778 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  24.56 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  23.05 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  23.9 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  24.62 
 
 		 399 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  21.93 
 
 		 678 aa  60.1  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  23.51 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  24.02 
 
 		 321 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  23.61 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  21.8 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2590  glycoside hydrolase family protein  21.45 
 
 		 639 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.549614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  24.57 
 
 		 689 aa  58.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  21.34 
 
 		 488 aa  57  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  21.72 
 
 		 364 aa  57  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  20.39 
 
 		 543 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  22.15 
 
 		 338 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  26.59 
 
 		 366 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  20.07 
 
 		 495 aa  56.2  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  21.89 
 
 		 457 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.53 
 
 		 697 aa  55.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  24.9 
 
 		 407 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  22.28 
 
 		 490 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  25.6 
 
 		 309 aa  54.3  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  21.65 
 
 		 829 aa  53.9  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  24.79 
 
 		 376 aa  53.9  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  21.35 
 
 		 389 aa  53.5  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  23.12 
 
 		 566 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0181  Beta-1 4-xylanase-like  22.39 
 
 		 574 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  23.26 
 
 		 1041 aa  53.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  22.33 
 
 		 619 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0896  glycoside hydrolase family 10  22.08 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  25.41 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  25.41 
 
 		 368 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  24.68 
 
 		 1276 aa  51.6  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  24.15 
 
 		 1037 aa  51.2  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  21.57 
 
 		 487 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  22.95 
 
 		 541 aa  50.4  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  23.94 
 
 		 373 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  22.61 
 
 		 451 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  22.97 
 
 		 1186 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  20.85 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  25.12 
 
 		 383 aa  48.5  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  22.43 
 
 		 374 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  24.86 
 
 		 317 aa  47.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  22.22 
 
 		 375 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  20.07 
 
 		 451 aa  47.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  20.42 
 
 		 370 aa  47.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  22.97 
 
 		 1019 aa  47.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  21.31 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  20 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  20.23 
 
 		 770 aa  45.8  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2391  Fibronectin type III domain protein  24.14 
 
 		 748 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.999424  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  22.51 
 
 		 1146 aa  45.4  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  21.85 
 
 		 394 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  22.15 
 
 		 324 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  23.23 
 
 		 1478 aa  44.3  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  20.41 
 
 		 806 aa  43.5  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>