More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1256 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1256  rare lipoprotein A  100 
 
 
109 aa  220  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2949  Rare lipoprotein A  75 
 
 
108 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3147  Rare lipoprotein A  75 
 
 
108 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000599592  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  51.11 
 
 
358 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  48.45 
 
 
171 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  43.22 
 
 
127 aa  88.2  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  51.65 
 
 
150 aa  87.8  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  48.89 
 
 
131 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
371 aa  86.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  48.89 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  48.89 
 
 
129 aa  86.3  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  53.33 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  46.6 
 
 
137 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  47.57 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  46.79 
 
 
121 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  53.33 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  47.37 
 
 
171 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  50 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  50 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  46.15 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  46.6 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  50 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  48.89 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  49.44 
 
 
367 aa  84.3  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  44.79 
 
 
157 aa  84  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  52.94 
 
 
121 aa  83.6  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  53.33 
 
 
124 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  44.25 
 
 
335 aa  83.6  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  48.89 
 
 
145 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  49.44 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  47.19 
 
 
360 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  47.19 
 
 
360 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  45.56 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  43.16 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  41.8 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0829  lipoproteins-like  41.96 
 
 
110 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  45.56 
 
 
249 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  47.19 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0455  lipoprotein A domain-containing protein  45.56 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  51.11 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  47.19 
 
 
270 aa  80.9  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3379  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  45 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  45.61 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  44.94 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  46.73 
 
 
118 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  47.78 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1446  rare lipoprotein A  45 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.52915  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  47.13 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  50 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  45.98 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  46.59 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  50 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  45.36 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  47.19 
 
 
230 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  47.19 
 
 
230 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  47.19 
 
 
211 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  51.11 
 
 
213 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  47.19 
 
 
242 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  47.19 
 
 
211 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  37.59 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  47.19 
 
 
211 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  47.19 
 
 
242 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  47.19 
 
 
211 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  52.56 
 
 
121 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  38.79 
 
 
199 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  48.89 
 
 
179 aa  76.6  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0747  rare lipoprotein A, putative  43.82 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479565  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  43.3 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  42.11 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0601  rare lipoprotein A  47.67 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000191646  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  45.87 
 
 
115 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  43.82 
 
 
342 aa  75.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  40.95 
 
 
239 aa  74.7  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  43.01 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  50.67 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0738  rare lipoprotein A  43.33 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  45.56 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1517  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000581263  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  44.94 
 
 
181 aa  73.9  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  43.82 
 
 
162 aa  73.6  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0615  rare lipoprotein A  46.51 
 
 
157 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.679180000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  40.82 
 
 
217 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  40.74 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  42.53 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  43.62 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0038  putative lipoprotein A  45.45 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  43.43 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  47.78 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  43.16 
 
 
120 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0046  rare lipoprotein A  45.36 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0201  rare lipoprotein A  33.58 
 
 
133 aa  72  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  49.33 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2181  rare lipoprotein A  45.56 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000683407  decreased coverage  0.000000439992 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  41.57 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0087  rare lipoprotein A  50 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  49.41 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  46.07 
 
 
125 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  39.05 
 
 
279 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>