More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0655 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  100 
 
 		 279 aa  580  1e-164  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  67.77 
 
 		 275 aa  352  5e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  67.77 
 
 		 275 aa  352  5e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  68.94 
 
 		 266 aa  348  6e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  60.91 
 
 		 239 aa  287  2e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  51.81 
 
 		 270 aa  260  1e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  48.46 
 
 		 286 aa  249  3e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  51.36 
 
 		 240 aa  238  1e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  52.94 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  50.66 
 
 		 264 aa  219  5e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  45.7 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  50.57 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  42.42 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  42.47 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  62.39 
 
 		 249 aa  158  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  41.82 
 
 		 238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  54.25 
 
 		 260 aa  141  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  37.22 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  33.93 
 
 		 264 aa  139  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  53.03 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  57.89 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  37.94 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  38.43 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  36.92 
 
 		 249 aa  136  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  52.05 
 
 		 265 aa  136  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  36.4 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  62.24 
 
 		 360 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  62.24 
 
 		 360 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  44.91 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  36.94 
 
 		 323 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  37.24 
 
 		 321 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  34.83 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  37.92 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  37.09 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  51.75 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  31.33 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0789  rare lipoprotein A  44.25 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  49.23 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  35.12 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  39.09 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  30.87 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  56.64 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  50.77 
 
 		 367 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  67.03 
 
 		 324 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  36.04 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  39.16 
 
 		 163 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 280 aa  129  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  63.04 
 
 		 342 aa  128  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  48.89 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  37.24 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  35.12 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  36.68 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  50.85 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  57.28 
 
 		 358 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  45.81 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  46.1 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  35.29 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  40.88 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  37.33 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  30.87 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  30.87 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  37.08 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  37.61 
 
 		 269 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  53.45 
 
 		 391 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  45.26 
 
 		 468 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  34.68 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1538  rare lipoprotein A  50.44 
 
 		 383 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.516723  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  31.79 
 
 		 342 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  39.63 
 
 		 455 aa  125  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  39.63 
 
 		 474 aa  125  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  63.74 
 
 		 262 aa  125  6e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  33.6 
 
 		 337 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  46.38 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  42.02 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  34.89 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  54.78 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  37.04 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 335 aa  122  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  47.15 
 
 		 442 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  37.39 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  46.92 
 
 		 283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  34.55 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  38.95 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  48.25 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  50.39 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  51.26 
 
 		 186 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  34.39 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  62.5 
 
 		 121 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  32.88 
 
 		 310 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  49.56 
 
 		 364 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  33.77 
 
 		 261 aa  119  7e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  33.77 
 
 		 265 aa  119  7e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  54.05 
 
 		 267 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  48.25 
 
 		 314 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  41.61 
 
 		 394 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  52.25 
 
 		 224 aa  118  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  54.08 
 
 		 157 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  59.55 
 
 		 140 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 162 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  59.55 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>