More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3960 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  100 
 
 
118 aa  238  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  67.27 
 
 
118 aa  154  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  71.58 
 
 
118 aa  151  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  71.58 
 
 
118 aa  151  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  63.21 
 
 
144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  60.87 
 
 
120 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  66.67 
 
 
120 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  69.05 
 
 
124 aa  132  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  63.83 
 
 
119 aa  124  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  54.05 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  60.87 
 
 
124 aa  116  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  52.99 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  65.56 
 
 
367 aa  115  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  67.11 
 
 
371 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  53.68 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  52.43 
 
 
115 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  52.43 
 
 
115 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  58.62 
 
 
124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  59.34 
 
 
358 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
324 aa  106  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  57.61 
 
 
125 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  55.21 
 
 
125 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  48.18 
 
 
239 aa  105  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  54.64 
 
 
139 aa  105  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  53.61 
 
 
127 aa  104  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
213 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  58.06 
 
 
262 aa  104  4e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  58.62 
 
 
140 aa  103  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  61.18 
 
 
179 aa  102  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  54.35 
 
 
131 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  45.45 
 
 
286 aa  102  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  54.17 
 
 
121 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  54.35 
 
 
131 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  52.58 
 
 
181 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
121 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  58.82 
 
 
122 aa  101  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  47.47 
 
 
122 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  53.33 
 
 
157 aa  100  8e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
163 aa  100  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
342 aa  100  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
124 aa  100  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  44.07 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  49.48 
 
 
167 aa  99.4  1e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  53.33 
 
 
360 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  57.3 
 
 
150 aa  99.4  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  56.82 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  53.33 
 
 
360 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  53.85 
 
 
124 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  45.87 
 
 
238 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  55.43 
 
 
166 aa  99  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  50 
 
 
249 aa  98.6  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  52.13 
 
 
163 aa  98.2  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  45.45 
 
 
270 aa  98.6  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  48.98 
 
 
221 aa  98.2  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  51.61 
 
 
137 aa  97.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  51.61 
 
 
114 aa  97.8  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
137 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  50 
 
 
129 aa  97.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  53.61 
 
 
199 aa  97.8  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  53.26 
 
 
147 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  56.47 
 
 
122 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  54.44 
 
 
270 aa  97.4  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
124 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  57.3 
 
 
165 aa  97.1  7e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  52 
 
 
303 aa  97.1  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  44.55 
 
 
243 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  45.45 
 
 
240 aa  97.1  7e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  42.73 
 
 
275 aa  96.7  9e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
137 aa  97.1  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  56.82 
 
 
257 aa  96.7  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  42.73 
 
 
275 aa  96.7  9e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  44.8 
 
 
127 aa  96.7  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  42.73 
 
 
266 aa  96.7  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0087  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
241 aa  96.7  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  56.63 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  53 
 
 
171 aa  96.3  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  53.85 
 
 
230 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  45.45 
 
 
196 aa  95.5  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  53.85 
 
 
242 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  53.85 
 
 
242 aa  95.5  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  53.85 
 
 
211 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  53.85 
 
 
230 aa  95.5  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0534  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
169 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  53.85 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
171 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  52.75 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  53.85 
 
 
211 aa  95.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  56.67 
 
 
160 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  56.67 
 
 
160 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3870  putative RlpA family protein  53.85 
 
 
238 aa  94.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  50.51 
 
 
249 aa  95.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  53.85 
 
 
211 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  53.85 
 
 
211 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0175  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
156 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  56.04 
 
 
202 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  48.04 
 
 
155 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  49.06 
 
 
324 aa  94.4  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>