More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2020 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  100 
 
 
139 aa  279  9e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  66.32 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  64.95 
 
 
163 aa  137  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  71.74 
 
 
171 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  66.04 
 
 
142 aa  134  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  65.26 
 
 
170 aa  133  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  57.89 
 
 
165 aa  133  8e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  52.52 
 
 
128 aa  133  9e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  63.64 
 
 
199 aa  129  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  62.77 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  68.09 
 
 
125 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  68.09 
 
 
125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  54.96 
 
 
134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  48.87 
 
 
124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  63.16 
 
 
211 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  61.05 
 
 
242 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  61.05 
 
 
230 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  61.05 
 
 
230 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  61.05 
 
 
242 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  61.05 
 
 
211 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  58.42 
 
 
175 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  61.05 
 
 
211 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  61.05 
 
 
211 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  58.7 
 
 
150 aa  121  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  49.18 
 
 
127 aa  120  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  62.64 
 
 
140 aa  121  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  57.27 
 
 
114 aa  120  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  56.25 
 
 
243 aa  120  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  60.42 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  56.84 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  62.64 
 
 
358 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  60.42 
 
 
124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  47.86 
 
 
198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  55.79 
 
 
186 aa  118  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  56.84 
 
 
203 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  60.82 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  55.79 
 
 
202 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  56.7 
 
 
122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  55.67 
 
 
286 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  60.4 
 
 
249 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  48.09 
 
 
119 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  56.7 
 
 
145 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
167 aa  117  7e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
213 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  52.99 
 
 
324 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  54.17 
 
 
263 aa  115  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  63.74 
 
 
335 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  59.38 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  48.25 
 
 
203 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
213 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
214 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  54.9 
 
 
259 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  52.5 
 
 
162 aa  115  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  53.06 
 
 
278 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  58.7 
 
 
367 aa  114  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  56.44 
 
 
221 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  51.67 
 
 
144 aa  114  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  51.38 
 
 
342 aa  114  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  51.58 
 
 
270 aa  114  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  52.63 
 
 
267 aa  114  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  53.68 
 
 
267 aa  113  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  55.43 
 
 
342 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  52.48 
 
 
332 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  55.1 
 
 
217 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  60.64 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  52.63 
 
 
163 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  57.8 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  45.99 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  57.89 
 
 
200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  56.25 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  54.35 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  55.79 
 
 
249 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  57.29 
 
 
212 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
279 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  56.84 
 
 
238 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  50.5 
 
 
335 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  53.85 
 
 
265 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  60.22 
 
 
370 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2902  rare lipoprotein A  63.74 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  57.14 
 
 
239 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  52.99 
 
 
120 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  51.46 
 
 
157 aa  111  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  46.55 
 
 
246 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  54.17 
 
 
259 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  65.06 
 
 
124 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  53.4 
 
 
227 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  56.84 
 
 
324 aa  110  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
196 aa  110  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  57.58 
 
 
123 aa  110  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  57.89 
 
 
200 aa  110  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  46.32 
 
 
281 aa  110  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  51.49 
 
 
333 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  53.06 
 
 
142 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  51.49 
 
 
333 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  60.78 
 
 
121 aa  110  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2221  rare lipoprotein A-like protein  54.95 
 
 
249 aa  110  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219986  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  53.12 
 
 
129 aa  110  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  57.29 
 
 
121 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>