More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0060 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  100 
 
 		 129 aa  260  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  72.5 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  70.83 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  70.83 
 
 		 137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  70.83 
 
 		 137 aa  180  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  72.07 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  65.83 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  68.47 
 
 		 147 aa  158  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  68.47 
 
 		 131 aa  157  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  58.2 
 
 		 127 aa  144  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  53.4 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  52.07 
 
 		 181 aa  121  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1517  rare lipoprotein A  49.21 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000581263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  51.35 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  54.26 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  48.67 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  55.43 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  56.04 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  55.56 
 
 		 267 aa  114  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  49.49 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  50.43 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  57.29 
 
 		 263 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  44.25 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  43.09 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  54.55 
 
 		 267 aa  110  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  54.08 
 
 		 360 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  53.12 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  54.08 
 
 		 360 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  42.11 
 
 		 142 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  52.58 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  43.36 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  44.26 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 249 aa  107  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 171 aa  107  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  50.54 
 
 		 196 aa  107  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0201  rare lipoprotein A  55.67 
 
 		 133 aa  106  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  51.61 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  46.43 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  42.98 
 
 		 119 aa  103  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 165 aa  103  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  50.53 
 
 		 227 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  41.88 
 
 		 199 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0738  rare lipoprotein A  54.64 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  45.16 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  43.75 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  49.45 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  53.06 
 
 		 239 aa  102  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  49.49 
 
 		 269 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  43.75 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  51.04 
 
 		 243 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  49.46 
 
 		 358 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  54.44 
 
 		 179 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  47.31 
 
 		 221 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1527  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 233 aa  100  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105659  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  48.57 
 
 		 367 aa  100  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  55.06 
 
 		 257 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  48.31 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  53.93 
 
 		 213 aa  100  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  43.93 
 
 		 121 aa  100  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  50.53 
 
 		 198 aa  100  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  44.92 
 
 		 120 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4774  rare lipoprotein A  39.83 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.480483  hitchhiker  0.000486811 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  50.54 
 
 		 186 aa  100  8e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  50.54 
 
 		 211 aa  100  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  50.54 
 
 		 242 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  50.54 
 
 		 230 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  47.25 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  50.54 
 
 		 230 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  50.54 
 
 		 242 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  51.65 
 
 		 261 aa  98.6  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  50.54 
 
 		 211 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 324 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  50.54 
 
 		 211 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  50.54 
 
 		 211 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  47.92 
 
 		 175 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  46.24 
 
 		 381 aa  98.2  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  52.13 
 
 		 217 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  48.96 
 
 		 254 aa  98.6  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  49.47 
 
 		 297 aa  98.2  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1446  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.52915  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  44.72 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  50 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2181  rare lipoprotein A  49.04 
 
 		 239 aa  97.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000683407  decreased coverage  0.000000439992 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  49.47 
 
 		 278 aa  97.4  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  50 
 
 		 371 aa  97.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  50 
 
 		 259 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  54.43 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  44.21 
 
 		 318 aa  97.1  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  50.54 
 
 		 124 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  47.47 
 
 		 202 aa  96.7  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  48.42 
 
 		 281 aa  96.3  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  51 
 
 		 270 aa  96.3  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  48.91 
 
 		 213 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>