More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4990 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  100 
 
 		 227 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  50.86 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  50.86 
 
 		 200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  45.65 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  66.32 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  44.44 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  44.44 
 
 		 230 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  44.44 
 
 		 242 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  44.44 
 
 		 242 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  44.44 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  44.44 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  44.44 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  44.44 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  65.62 
 
 		 175 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  58.06 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  59.14 
 
 		 202 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  42.05 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  38.31 
 
 		 297 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  58.06 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  58.06 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  39.89 
 
 		 278 aa  125  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  62.77 
 
 		 360 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  62.77 
 
 		 360 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  56.25 
 
 		 206 aa  124  9e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  56.25 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  58.95 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  52.88 
 
 		 198 aa  123  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3465  rare lipoprotein A  40.93 
 
 		 250 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  44 
 
 		 323 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  53.12 
 
 		 267 aa  122  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  53.54 
 
 		 267 aa  121  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  54.46 
 
 		 321 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  52.53 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3137  rare lipoprotein A  40.28 
 
 		 250 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  53.45 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  64.13 
 
 		 94 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  50.98 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  53.06 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  61.29 
 
 		 121 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  55.67 
 
 		 286 aa  118  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 324 aa  118  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  50.85 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  41.5 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  63.33 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  50.79 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  61.7 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  49.02 
 
 		 270 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  51.49 
 
 		 341 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  50.39 
 
 		 142 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  40.14 
 
 		 283 aa  116  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  50 
 
 		 325 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  50.5 
 
 		 342 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  37.31 
 
 		 342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  37.31 
 
 		 342 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  47.86 
 
 		 264 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  60 
 
 		 257 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  57.89 
 
 		 285 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  40.14 
 
 		 280 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  38.73 
 
 		 281 aa  115  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  50 
 
 		 293 aa  115  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  50.98 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  49.54 
 
 		 170 aa  115  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  45.26 
 
 		 258 aa  115  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  40.14 
 
 		 280 aa  115  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  38.73 
 
 		 277 aa  115  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  40.14 
 
 		 280 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  51.96 
 
 		 332 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  54.05 
 
 		 121 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  46.46 
 
 		 269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  51.67 
 
 		 238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  51.96 
 
 		 333 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  53.06 
 
 		 322 aa  114  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  49.51 
 
 		 335 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  61.29 
 
 		 121 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 249 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  38.73 
 
 		 277 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  51.96 
 
 		 333 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  38.73 
 
 		 277 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  38.73 
 
 		 277 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  47.9 
 
 		 166 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  62.37 
 
 		 122 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  55.91 
 
 		 144 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  46.96 
 
 		 163 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  50.51 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  53.61 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  53.54 
 
 		 281 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  61.29 
 
 		 122 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  55.88 
 
 		 358 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  55.67 
 
 		 367 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 145 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  42.22 
 
 		 260 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  50.98 
 
 		 333 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  60.67 
 
 		 335 aa  113  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 310 aa  112  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  58.95 
 
 		 391 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  51.79 
 
 		 165 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  45.97 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>