More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2591 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  100 
 
 
278 aa  578  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  56.77 
 
 
297 aa  323  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  53.43 
 
 
277 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  53.07 
 
 
277 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  53.07 
 
 
277 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  53.74 
 
 
281 aa  310  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  52.71 
 
 
277 aa  308  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  55.22 
 
 
265 aa  305  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  56.25 
 
 
270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  53.96 
 
 
264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  57.85 
 
 
265 aa  300  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  58.92 
 
 
260 aa  298  8e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  58.4 
 
 
280 aa  297  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  58.4 
 
 
280 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  57.98 
 
 
280 aa  296  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  57.56 
 
 
283 aa  294  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  50.38 
 
 
260 aa  258  5.0000000000000005e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  48.87 
 
 
267 aa  251  9.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  47.86 
 
 
269 aa  247  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  49.17 
 
 
263 aa  243  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  46.62 
 
 
267 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  42.95 
 
 
293 aa  239  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  38.91 
 
 
322 aa  227  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  41.26 
 
 
290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  40.64 
 
 
321 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  43.45 
 
 
285 aa  195  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  40.07 
 
 
311 aa  194  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  38.59 
 
 
297 aa  193  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  40.07 
 
 
295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  44.74 
 
 
286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  52.94 
 
 
323 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  36.45 
 
 
324 aa  185  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  37.09 
 
 
342 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  50.25 
 
 
342 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  37.58 
 
 
335 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  37.77 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  38.13 
 
 
273 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  54.91 
 
 
342 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  55.23 
 
 
341 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  42.01 
 
 
257 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  59.86 
 
 
417 aa  176  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  59.86 
 
 
415 aa  176  5e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  35.65 
 
 
333 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  54.82 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  36.91 
 
 
333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  60.14 
 
 
423 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  46.77 
 
 
381 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  53.41 
 
 
337 aa  172  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  38.52 
 
 
261 aa  172  5e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  38.52 
 
 
265 aa  172  5e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  50 
 
 
332 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  36.59 
 
 
333 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  45.26 
 
 
310 aa  169  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  63.7 
 
 
391 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  44.12 
 
 
243 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  49.72 
 
 
471 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  37.7 
 
 
333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  57.04 
 
 
331 aa  163  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  46.39 
 
 
409 aa  162  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  34.44 
 
 
284 aa  160  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  43.52 
 
 
259 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  40.72 
 
 
246 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  42.78 
 
 
394 aa  155  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  41.56 
 
 
258 aa  149  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  45.79 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  41.75 
 
 
238 aa  145  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  42.78 
 
 
352 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  40.28 
 
 
255 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  42.86 
 
 
230 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  43.46 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  48.95 
 
 
370 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  45.3 
 
 
408 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  51.85 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  51.16 
 
 
375 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  35.47 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  53.28 
 
 
283 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  53.54 
 
 
270 aa  139  7e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  40.39 
 
 
249 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  37.74 
 
 
259 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  51.09 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  36.97 
 
 
249 aa  136  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2966  rare lipoprotein A  40.45 
 
 
381 aa  135  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  39.6 
 
 
239 aa  135  5e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  44.69 
 
 
312 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  43.5 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  54.78 
 
 
468 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  30.41 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  54.78 
 
 
474 aa  132  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  40.43 
 
 
394 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  54.78 
 
 
455 aa  132  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  43.33 
 
 
424 aa  132  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  52.8 
 
 
382 aa  132  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  47.01 
 
 
360 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  53.51 
 
 
442 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  49.64 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  47.01 
 
 
360 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  50.36 
 
 
312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  47.01 
 
 
360 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  56.6 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  41.57 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>