More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0611 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  100 
 
 		 167 aa  336  8e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  73.2 
 
 		 163 aa  157  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  65.56 
 
 		 163 aa  130  7.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  57.45 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  55.34 
 
 		 170 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  54.29 
 
 		 324 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 124 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  50 
 
 		 199 aa  120  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  58.06 
 
 		 121 aa  120  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  50 
 
 		 124 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  52.81 
 
 		 140 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 358 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2181  rare lipoprotein A  58.43 
 
 		 239 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000683407  decreased coverage  0.000000439992 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  60 
 
 		 121 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  62.64 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  48.15 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 121 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  60.87 
 
 		 163 aa  117  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  55.32 
 
 		 137 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  46.28 
 
 		 134 aa  117  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  57.43 
 
 		 261 aa  117  9e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 127 aa  117  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  56.38 
 
 		 137 aa  117  9e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 139 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 342 aa  116  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  55.32 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  43.97 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  55.32 
 
 		 137 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  55.32 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  54.26 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  50.52 
 
 		 212 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 360 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 360 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  57.3 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  55.43 
 
 		 171 aa  114  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  47.62 
 
 		 122 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  56.38 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1446  rare lipoprotein A  52.48 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.52915  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  47.06 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 367 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3870  putative RlpA family protein  51.09 
 
 		 238 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  47.41 
 
 		 242 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  47.41 
 
 		 242 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 262 aa  111  4.0000000000000004e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  47.41 
 
 		 230 aa  111  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  51.06 
 
 		 131 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  35.54 
 
 		 293 aa  111  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  47.41 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  55.43 
 
 		 249 aa  110  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  47.41 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  35.09 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  47.41 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  55.43 
 
 		 339 aa  110  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  55.21 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 265 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  47.31 
 
 		 144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  36.02 
 
 		 179 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  46.55 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  46.55 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 265 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  51.06 
 
 		 131 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  45.05 
 
 		 142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  51.06 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  45.37 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  50 
 
 		 239 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  52 
 
 		 122 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  47.31 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  48.45 
 
 		 200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0738  rare lipoprotein A  62.5 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  53.85 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  45.63 
 
 		 335 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1517  rare lipoprotein A  52.69 
 
 		 127 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000581263  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 238 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 322 aa  108  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  50 
 
 		 259 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  52.63 
 
 		 337 aa  107  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  48.91 
 
 		 114 aa  108  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  48.39 
 
 		 324 aa  108  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  40.71 
 
 		 371 aa  107  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  46.24 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  46.74 
 
 		 246 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  48.91 
 
 		 168 aa  107  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 321 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  47.25 
 
 		 394 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  48 
 
 		 264 aa  106  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  53.93 
 
 		 179 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  43.86 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  53.93 
 
 		 213 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 282 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  52.69 
 
 		 198 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  45.1 
 
 		 123 aa  106  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>