More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1713 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  100 
 
 
293 aa  603  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  47.59 
 
 
264 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  47.62 
 
 
265 aa  243  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  46.26 
 
 
265 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  48.15 
 
 
260 aa  239  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  42.95 
 
 
278 aa  239  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  43.1 
 
 
297 aa  233  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  44.37 
 
 
270 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  44.32 
 
 
283 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  45.08 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  45.08 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  44.32 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  41.86 
 
 
322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  40.07 
 
 
277 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  40 
 
 
277 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  40 
 
 
277 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  39.26 
 
 
281 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  41.55 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  39.32 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  42.36 
 
 
267 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  43.94 
 
 
269 aa  210  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  41.67 
 
 
267 aa  209  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  37.46 
 
 
321 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  42.18 
 
 
263 aa  205  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  45.02 
 
 
311 aa  203  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  38.71 
 
 
290 aa  201  9e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  40.23 
 
 
285 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  37.14 
 
 
324 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  39.78 
 
 
295 aa  172  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  37.93 
 
 
297 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  36.42 
 
 
323 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  39.83 
 
 
310 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  36.4 
 
 
257 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  38.55 
 
 
337 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  51.02 
 
 
417 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  44.81 
 
 
471 aa  159  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  51.02 
 
 
415 aa  159  8e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  53.85 
 
 
423 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  39.91 
 
 
335 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  39.83 
 
 
342 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  48.59 
 
 
286 aa  155  9e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  35.93 
 
 
284 aa  155  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  39.3 
 
 
342 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  36.94 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  51.63 
 
 
391 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  51.33 
 
 
273 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  46.77 
 
 
333 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  35.57 
 
 
341 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  34.31 
 
 
352 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  41.62 
 
 
381 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  46.78 
 
 
342 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  38.53 
 
 
325 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  37.32 
 
 
265 aa  149  6e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  37.32 
 
 
261 aa  149  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  45.7 
 
 
333 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  36.59 
 
 
282 aa  149  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  43.48 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  50.35 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  43.72 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  34.93 
 
 
246 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  34.67 
 
 
243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  48.84 
 
 
394 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  38.22 
 
 
259 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  36.25 
 
 
333 aa  142  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  48.72 
 
 
254 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  45.34 
 
 
249 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  41.62 
 
 
264 aa  135  9e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  52.31 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  47.01 
 
 
409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  45 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  38.19 
 
 
281 aa  133  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  41.86 
 
 
424 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  34.48 
 
 
259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  56.25 
 
 
211 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  52.88 
 
 
200 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  41.57 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  65.93 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  49.6 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  45.39 
 
 
199 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  56.25 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  50.78 
 
 
314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  55.75 
 
 
270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  49.55 
 
 
468 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  36.12 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  56.25 
 
 
242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  56.25 
 
 
242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  50.4 
 
 
283 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  48.65 
 
 
474 aa  129  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  49.23 
 
 
382 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  56.25 
 
 
230 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  45.51 
 
 
258 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  56.25 
 
 
230 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  48.65 
 
 
455 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  50 
 
 
315 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  56.25 
 
 
211 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  56.25 
 
 
211 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  56.25 
 
 
211 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  53.04 
 
 
238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  40.11 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  48.82 
 
 
419 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>