More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0319 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  100 
 
 		 186 aa  376  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  55 
 
 		 321 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  61.46 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  61.46 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  61.46 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  61.46 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  57.76 
 
 		 342 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  61.46 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  61.46 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  61.46 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  51.18 
 
 		 278 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  53.45 
 
 		 323 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 322 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  56.76 
 
 		 171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 255 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  58.33 
 
 		 202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  56.03 
 
 		 342 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  61.46 
 
 		 211 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  51.09 
 
 		 239 aa  127  7.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  60.87 
 
 		 163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  49.64 
 
 		 285 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  56.03 
 
 		 335 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  50.4 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  50.4 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  50.4 
 
 		 280 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  42.41 
 
 		 249 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  56.03 
 
 		 297 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  50 
 
 		 342 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  50.4 
 
 		 283 aa  125  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  55.17 
 
 		 333 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  56.84 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  48.28 
 
 		 341 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  50.39 
 
 		 318 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  54.31 
 
 		 332 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  56.84 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  50.82 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  49.6 
 
 		 270 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  53.1 
 
 		 282 aa  124  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  48.87 
 
 		 260 aa  124  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  54.31 
 
 		 333 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  52.94 
 
 		 275 aa  123  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  58.51 
 
 		 360 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  42.25 
 
 		 333 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  52.94 
 
 		 275 aa  123  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  58.51 
 
 		 360 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  52.94 
 
 		 266 aa  123  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  43.4 
 
 		 468 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  52.59 
 
 		 264 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  52.59 
 
 		 265 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  48.46 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  48.18 
 
 		 265 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  48.8 
 
 		 277 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  46.62 
 
 		 281 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  47.73 
 
 		 286 aa  122  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  48.8 
 
 		 277 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  48.8 
 
 		 277 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  44.68 
 
 		 474 aa  122  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  55.79 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  48.8 
 
 		 277 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  51.22 
 
 		 322 aa  122  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  53.61 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  48.12 
 
 		 370 aa  122  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  53.15 
 
 		 339 aa  122  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  52.59 
 
 		 417 aa  122  4e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  54.74 
 
 		 124 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  55.21 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  52.59 
 
 		 415 aa  122  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  63.33 
 
 		 163 aa  122  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  44.68 
 
 		 455 aa  121  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  46.56 
 
 		 297 aa  121  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  57.29 
 
 		 200 aa  121  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  53.12 
 
 		 203 aa  121  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  46.67 
 
 		 206 aa  121  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  52.94 
 
 		 165 aa  121  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  56.64 
 
 		 337 aa  121  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  51.26 
 
 		 279 aa  121  7e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  49.57 
 
 		 324 aa  121  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  47.62 
 
 		 325 aa  120  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  53.12 
 
 		 203 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  53.04 
 
 		 314 aa  120  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  46.67 
 
 		 206 aa  120  9e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  51.15 
 
 		 310 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  57.29 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  51.26 
 
 		 259 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 360 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  52.58 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  51.55 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  50.79 
 
 		 295 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  58.16 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 360 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  51.28 
 
 		 341 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 375 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  51.75 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 360 aa  119  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  52.21 
 
 		 150 aa  119  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  45.58 
 
 		 270 aa  119  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  50.44 
 
 		 311 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  57.29 
 
 		 367 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  48.31 
 
 		 230 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>