More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4765 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  100 
 
 
179 aa  355  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  53.69 
 
 
257 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  65.59 
 
 
213 aa  127  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0087  rare lipoprotein A  61.7 
 
 
241 aa  122  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  62.79 
 
 
119 aa  120  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2181  rare lipoprotein A  61.29 
 
 
239 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000683407  decreased coverage  0.000000439992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  63.33 
 
 
140 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  61.8 
 
 
127 aa  114  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  58.14 
 
 
153 aa  110  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  61.96 
 
 
142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1527  rare lipoprotein A  59.34 
 
 
233 aa  108  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0105659  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  55.32 
 
 
367 aa  108  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  59.14 
 
 
120 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
167 aa  107  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  62.07 
 
 
124 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  58.24 
 
 
157 aa  106  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  52.46 
 
 
358 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  50 
 
 
360 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  50 
 
 
360 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  43.61 
 
 
324 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  58.06 
 
 
120 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  60.47 
 
 
144 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  60.44 
 
 
134 aa  104  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  57.3 
 
 
114 aa  103  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  57.3 
 
 
239 aa  103  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  51.92 
 
 
127 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  58.43 
 
 
125 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  53.85 
 
 
342 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
124 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  57.89 
 
 
162 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  58.16 
 
 
199 aa  102  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  52.69 
 
 
131 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  54.44 
 
 
129 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  61.18 
 
 
118 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  55 
 
 
125 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  52.69 
 
 
131 aa  101  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  60.47 
 
 
118 aa  101  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  56.32 
 
 
115 aa  101  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  60.47 
 
 
118 aa  101  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  56.32 
 
 
115 aa  101  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  50.36 
 
 
211 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  52.22 
 
 
137 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  53.76 
 
 
371 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  57.78 
 
 
139 aa  100  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  61.45 
 
 
118 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  52.22 
 
 
137 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  52.22 
 
 
137 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  66.67 
 
 
124 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  52.69 
 
 
147 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  52.22 
 
 
137 aa  99.4  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
175 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
262 aa  99  3e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0676  rare lipoprotein A  54.76 
 
 
117 aa  98.6  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  61.64 
 
 
115 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  56.18 
 
 
122 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  48.92 
 
 
230 aa  98.6  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  54.44 
 
 
181 aa  98.2  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  51.11 
 
 
137 aa  98.2  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  62.67 
 
 
121 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 
242 aa  98.2  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 
242 aa  98.2  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 
230 aa  97.8  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 
211 aa  97.8  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 
211 aa  97.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 
211 aa  97.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  52.81 
 
 
170 aa  97.8  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  55.29 
 
 
124 aa  97.4  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  65.33 
 
 
121 aa  97.4  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  53.85 
 
 
261 aa  97.1  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  53.76 
 
 
214 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  62.67 
 
 
122 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  50.56 
 
 
275 aa  96.3  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  53.93 
 
 
165 aa  96.3  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  47.57 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  50.56 
 
 
275 aa  96.3  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  50.56 
 
 
266 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  51.09 
 
 
267 aa  96.3  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  46.09 
 
 
202 aa  96.3  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  42.75 
 
 
270 aa  96.7  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
145 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  56.18 
 
 
124 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  61.33 
 
 
121 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  49.46 
 
 
267 aa  95.5  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  50.52 
 
 
342 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  50.52 
 
 
341 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  56.04 
 
 
124 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  61.33 
 
 
122 aa  94.7  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  44.36 
 
 
417 aa  94.7  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  51.69 
 
 
279 aa  94.7  6e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  45.16 
 
 
415 aa  94.7  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  46.09 
 
 
203 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  46.09 
 
 
213 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  54.55 
 
 
198 aa  94.4  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  53.85 
 
 
367 aa  94.4  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  58.33 
 
 
249 aa  94.4  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  48.08 
 
 
263 aa  94.4  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  46.09 
 
 
214 aa  94  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  56.32 
 
 
94 aa  94  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.7858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>