More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1475 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  100 
 
 		 124 aa  243  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  84.03 
 
 		 124 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  78.26 
 
 		 116 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  67.26 
 
 		 115 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  69.23 
 
 		 115 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  69.23 
 
 		 115 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  67.26 
 
 		 121 aa  140  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  65.18 
 
 		 121 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  56.78 
 
 		 119 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  67.02 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  57.02 
 
 		 122 aa  123  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  64.42 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  65.82 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  56.31 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  53.91 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  63.64 
 
 		 125 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  71.25 
 
 		 211 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  54.4 
 
 		 324 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  70 
 
 		 242 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  70 
 
 		 242 aa  117  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  65.26 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  70 
 
 		 230 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  70 
 
 		 230 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 118 aa  117  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  70 
 
 		 211 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  70 
 
 		 211 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  70 
 
 		 211 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  61.96 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  67.44 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  73.75 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  73.75 
 
 		 124 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  71.05 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5674  rare lipoprotein A  71.26 
 
 		 110 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  65.93 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  65.93 
 
 		 358 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  62.77 
 
 		 212 aa  111  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  72.5 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  63.83 
 
 		 199 aa  111  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  58.06 
 
 		 360 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  58.06 
 
 		 360 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  64.04 
 
 		 367 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  71.25 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  69.23 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  63.74 
 
 		 200 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  59.57 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  48.28 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  60.44 
 
 		 170 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 202 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 203 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  55.1 
 
 		 150 aa  106  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  62.22 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 124 aa  105  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  50.51 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 203 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  62.64 
 
 		 200 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  57.29 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  62.22 
 
 		 257 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 163 aa  104  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  59.55 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  58.43 
 
 		 213 aa  103  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 214 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 198 aa  103  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  62.5 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 203 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  56.7 
 
 		 139 aa  103  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  65.43 
 
 		 367 aa  103  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  69.23 
 
 		 142 aa  103  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  59.78 
 
 		 165 aa  103  9e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  58.51 
 
 		 303 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  50.43 
 
 		 199 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  62.5 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0676  rare lipoprotein A  63.01 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  62.5 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 213 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  53.64 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 171 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  49.55 
 
 		 261 aa  101  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  59.55 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  55.91 
 
 		 163 aa  101  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 206 aa  101  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  53.76 
 
 		 206 aa  100  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  56.57 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  55 
 
 		 227 aa  100  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  60 
 
 		 122 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 179 aa  100  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0534  rare lipoprotein A  63.75 
 
 		 169 aa  100  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 186 aa  100  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  58.43 
 
 		 342 aa  100  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2972  lipoprotein A domain-containing protein  53.85 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  56.32 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  56.32 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  52.69 
 
 		 375 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1199  rare lipoprotein A  55.91 
 
 		 361 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.670363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  52.48 
 
 		 181 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 332 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 221 aa  98.2  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>