More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0471 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  100 
 
 		 263 aa  547  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  68.82 
 
 		 267 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  66.54 
 
 		 267 aa  360  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  54.8 
 
 		 269 aa  286  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  50.2 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  54.32 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  50 
 
 		 265 aa  254  9e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  48.48 
 
 		 270 aa  251  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  48.09 
 
 		 278 aa  249  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  50.2 
 
 		 264 aa  247  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  51.48 
 
 		 297 aa  245  6e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  46.88 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  43.33 
 
 		 281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  46.61 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  46.19 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  46.19 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  43.13 
 
 		 277 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  43.13 
 
 		 277 aa  231  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  43.13 
 
 		 277 aa  231  6e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  45.76 
 
 		 280 aa  231  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  42.37 
 
 		 277 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  41.7 
 
 		 293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  40 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  35.58 
 
 		 321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  38.01 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  40.29 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  55.68 
 
 		 297 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  40.47 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  53.09 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  44.83 
 
 		 323 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  36.98 
 
 		 324 aa  168  7e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  55.92 
 
 		 415 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  56.55 
 
 		 417 aa  166  5e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  56.64 
 
 		 471 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  39.48 
 
 		 273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  54.23 
 
 		 423 aa  162  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  39.91 
 
 		 286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  49.04 
 
 		 381 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  39.48 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  52.9 
 
 		 342 aa  160  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  38.4 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  38.49 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  38.49 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  47.22 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  43.82 
 
 		 370 aa  158  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  46.67 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  51.27 
 
 		 391 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  54.61 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  47.97 
 
 		 310 aa  155  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  52.48 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  43.26 
 
 		 375 aa  155  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  44.81 
 
 		 333 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  52.48 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  50.34 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  50.96 
 
 		 337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  52.48 
 
 		 333 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  34.13 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  37.5 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2966  rare lipoprotein A  44.77 
 
 		 381 aa  148  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  52.45 
 
 		 325 aa  148  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  35.82 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  47.95 
 
 		 394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  52.24 
 
 		 360 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  52.24 
 
 		 360 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  52.24 
 
 		 360 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  36 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  48.3 
 
 		 352 aa  145  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1090  rare lipoprotein A  43.58 
 
 		 388 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499967  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  48.63 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  41.67 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  45.32 
 
 		 409 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1199  rare lipoprotein A  41.86 
 
 		 361 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.670363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  42.4 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  41.15 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  42.93 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  35.02 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  36.86 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  43.78 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  60.61 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  52.63 
 
 		 442 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  39.22 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  39.57 
 
 		 200 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  62.5 
 
 		 242 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  62.5 
 
 		 242 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  50.88 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  39.57 
 
 		 200 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  62.5 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  62.5 
 
 		 230 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  62.5 
 
 		 211 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  62.5 
 
 		 211 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  62.5 
 
 		 211 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  38.61 
 
 		 322 aa  135  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  50.39 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  41.35 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  53.04 
 
 		 468 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  50.37 
 
 		 246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  53.51 
 
 		 408 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  55.05 
 
 		 203 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>