More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0252 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  100 
 
 		 170 aa  349  8.999999999999999e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  67.53 
 
 		 163 aa  219  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  51.9 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  64.81 
 
 		 163 aa  155  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  70.65 
 
 		 171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  70.65 
 
 		 171 aa  140  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  67.78 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  64.84 
 
 		 140 aa  135  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  65.26 
 
 		 139 aa  133  9e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  61.22 
 
 		 360 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  61.22 
 
 		 360 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  60.64 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  62.37 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  50.38 
 
 		 342 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  54.78 
 
 		 211 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  61.62 
 
 		 324 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  43.67 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  53.91 
 
 		 230 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  53.91 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  53.91 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  60.44 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  53.91 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  53.91 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  53.91 
 
 		 230 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  53.91 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  55.34 
 
 		 167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  61.29 
 
 		 121 aa  124  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  60.44 
 
 		 124 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  51.79 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  62.22 
 
 		 358 aa  124  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  56.86 
 
 		 335 aa  124  9e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  60.44 
 
 		 124 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 200 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  53.7 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  41.57 
 
 		 199 aa  121  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  41.67 
 
 		 213 aa  121  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  62.22 
 
 		 122 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  56 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 259 aa  121  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  48.74 
 
 		 198 aa  121  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  54.74 
 
 		 282 aa  120  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 124 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  48.72 
 
 		 202 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  40.13 
 
 		 264 aa  119  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  39.43 
 
 		 408 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  52.83 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  61.96 
 
 		 262 aa  119  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  52.34 
 
 		 468 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  52.34 
 
 		 265 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  58.06 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  53.77 
 
 		 214 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  37.65 
 
 		 267 aa  118  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  52.83 
 
 		 203 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  57.61 
 
 		 254 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 270 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  55.32 
 
 		 263 aa  117  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 114 aa  117  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  56.67 
 
 		 239 aa  117  7e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  51.4 
 
 		 474 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  55.06 
 
 		 337 aa  117  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  55.43 
 
 		 442 aa  117  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  51.4 
 
 		 455 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  53.92 
 
 		 157 aa  117  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  53.76 
 
 		 181 aa  117  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  59.14 
 
 		 124 aa  117  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  60.22 
 
 		 371 aa  117  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  60 
 
 		 370 aa  117  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  39.29 
 
 		 293 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  54.35 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  51.89 
 
 		 203 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  61.36 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  38.61 
 
 		 240 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  51.89 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  51.89 
 
 		 213 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  51.4 
 
 		 265 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 275 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 266 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 275 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  60.67 
 
 		 212 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  42.19 
 
 		 342 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  40.24 
 
 		 264 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  53.47 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  54.26 
 
 		 260 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  43.08 
 
 		 341 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  41.36 
 
 		 322 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 246 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  56.52 
 
 		 259 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  49.52 
 
 		 367 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  53.61 
 
 		 238 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 279 aa  115  3e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  59.55 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  41.18 
 
 		 249 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  48.6 
 
 		 270 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  59.55 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>