More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1489 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  100 
 
 		 122 aa  240  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  86.07 
 
 		 122 aa  207  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  68.03 
 
 		 121 aa  164  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  64.75 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  74.76 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  73.86 
 
 		 324 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  73.03 
 
 		 358 aa  133  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  65.45 
 
 		 115 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  65.45 
 
 		 115 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  67.78 
 
 		 360 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  67.78 
 
 		 360 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  65.14 
 
 		 115 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  66.29 
 
 		 163 aa  130  9e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  69.47 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  71.59 
 
 		 335 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  71.43 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  66.29 
 
 		 342 aa  125  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  67.02 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  63.33 
 
 		 211 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  62.22 
 
 		 170 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  62.22 
 
 		 242 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  62.22 
 
 		 242 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  62.22 
 
 		 230 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  62.22 
 
 		 230 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  62.22 
 
 		 211 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  62.22 
 
 		 211 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  69.32 
 
 		 199 aa  120  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  62.22 
 
 		 211 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  60.22 
 
 		 206 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  64.04 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  64.44 
 
 		 200 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  59.14 
 
 		 206 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  65.52 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  59.77 
 
 		 303 aa  117  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  63.64 
 
 		 367 aa  116  9e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  55.96 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  63.33 
 
 		 200 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  55.96 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  54.95 
 
 		 230 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  63.41 
 
 		 238 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  65 
 
 		 202 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  59.14 
 
 		 198 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  58 
 
 		 155 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  62.37 
 
 		 212 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  60.67 
 
 		 239 aa  114  5e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0451  rare lipoprotein A  90.62 
 
 		 64 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108801  normal  0.956063 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  55.05 
 
 		 124 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  60 
 
 		 203 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  60 
 
 		 203 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  61.29 
 
 		 227 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  60.67 
 
 		 275 aa  113  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  59.18 
 
 		 249 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  60.67 
 
 		 275 aa  113  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  57.58 
 
 		 168 aa  113  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  61.11 
 
 		 199 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  60.67 
 
 		 266 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  62.65 
 
 		 213 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  60.67 
 
 		 279 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  65.93 
 
 		 371 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  60.87 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  61.36 
 
 		 322 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  58.51 
 
 		 261 aa  111  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  60.98 
 
 		 254 aa  111  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  63.75 
 
 		 203 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  59.14 
 
 		 240 aa  111  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  63.75 
 
 		 213 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  55.79 
 
 		 263 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  62.92 
 
 		 196 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  61.73 
 
 		 262 aa  111  4.0000000000000004e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  63.75 
 
 		 213 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  46.88 
 
 		 186 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  60.23 
 
 		 282 aa  110  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  62.5 
 
 		 367 aa  110  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  56.38 
 
 		 224 aa  110  6e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  59.49 
 
 		 270 aa  110  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  63.75 
 
 		 94 aa  110  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  62.5 
 
 		 214 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  51.64 
 
 		 118 aa  110  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  59.55 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  52 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  62.07 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 243 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  51.28 
 
 		 181 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  49.54 
 
 		 258 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  56.18 
 
 		 270 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  57.32 
 
 		 249 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  61.8 
 
 		 171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  59.57 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  61.63 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  53.1 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 339 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  54.9 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  60 
 
 		 163 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  56.18 
 
 		 286 aa  107  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  55.91 
 
 		 251 aa  107  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  56.52 
 
 		 331 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  58.02 
 
 		 284 aa  107  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  59.55 
 
 		 221 aa  106  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 166 aa  106  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>