More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1357 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  100 
 
 
199 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  48.98 
 
 
211 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  48.3 
 
 
242 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  48.3 
 
 
242 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  48.3 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  48.3 
 
 
230 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  70.21 
 
 
142 aa  132  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  60 
 
 
342 aa  132  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  59.43 
 
 
360 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  59.43 
 
 
360 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  46.15 
 
 
163 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  68.48 
 
 
358 aa  131  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  48.3 
 
 
211 aa  131  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  48.3 
 
 
211 aa  131  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  48.3 
 
 
211 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  67.74 
 
 
124 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  62.26 
 
 
121 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  67.74 
 
 
124 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  65.59 
 
 
124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  62.62 
 
 
121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  63.64 
 
 
139 aa  129  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  62.37 
 
 
170 aa  129  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  68.82 
 
 
155 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  43.75 
 
 
163 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  63.27 
 
 
212 aa  128  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  63.44 
 
 
203 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  65.96 
 
 
124 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  63.44 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  67.03 
 
 
324 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  62.37 
 
 
214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  66.33 
 
 
121 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  67.42 
 
 
140 aa  125  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  42.6 
 
 
163 aa  124  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  61.29 
 
 
202 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  62.5 
 
 
165 aa  124  8.000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  53.45 
 
 
367 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  48.72 
 
 
371 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  61.7 
 
 
145 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  43.17 
 
 
168 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  59.57 
 
 
198 aa  123  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  61.54 
 
 
144 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  60.22 
 
 
203 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  61.39 
 
 
157 aa  122  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  60.22 
 
 
213 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  60.22 
 
 
213 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  47.37 
 
 
323 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  64.13 
 
 
335 aa  122  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  45.75 
 
 
285 aa  121  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
150 aa  121  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  48.18 
 
 
324 aa  121  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  50 
 
 
167 aa  121  8e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  62.11 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  69.32 
 
 
122 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  60.87 
 
 
128 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  61.29 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  61.29 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  62.64 
 
 
134 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  55.91 
 
 
243 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  61.7 
 
 
145 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  57.89 
 
 
206 aa  119  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  57.61 
 
 
342 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  57.89 
 
 
206 aa  119  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  48.23 
 
 
381 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  58.06 
 
 
332 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  54.72 
 
 
239 aa  118  4.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  60.64 
 
 
122 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  68.18 
 
 
122 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  58.42 
 
 
123 aa  118  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  56.52 
 
 
341 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  59.14 
 
 
199 aa  118  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  47.11 
 
 
127 aa  117  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  58.51 
 
 
171 aa  117  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  61.54 
 
 
227 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  52.53 
 
 
342 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0045  rare lipoprotein A  47.14 
 
 
283 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  46.34 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  63.83 
 
 
125 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  56.12 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  56.84 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  63.16 
 
 
125 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  52.58 
 
 
342 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  45.33 
 
 
286 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  55.32 
 
 
297 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  56.99 
 
 
333 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  55.32 
 
 
442 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  56.99 
 
 
166 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  56.99 
 
 
333 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  59.34 
 
 
142 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  51.55 
 
 
314 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  58.06 
 
 
259 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  59.57 
 
 
270 aa  114  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  56.76 
 
 
175 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  55.32 
 
 
335 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  55.43 
 
 
337 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  54.84 
 
 
468 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  54.55 
 
 
124 aa  114  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  40.11 
 
 
179 aa  114  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  53.61 
 
 
281 aa  114  8.999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  39.52 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  44.6 
 
 
278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>