More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1622 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  100 
 
 		 157 aa  319  9.000000000000001e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  58.94 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  56.49 
 
 		 196 aa  148  3e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  57.36 
 
 		 179 aa  145  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  51.97 
 
 		 221 aa  144  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  68.09 
 
 		 342 aa  139  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  63.83 
 
 		 360 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  63.83 
 
 		 360 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  66 
 
 		 324 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  56.12 
 
 		 275 aa  130  7.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  56.12 
 
 		 275 aa  130  7.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  56.12 
 
 		 266 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  65.93 
 
 		 358 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  60.2 
 
 		 335 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  58 
 
 		 262 aa  125  3e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  51.28 
 
 		 242 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  56.41 
 
 		 371 aa  123  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  51.28 
 
 		 242 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  51.28 
 
 		 230 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  51.28 
 
 		 211 aa  122  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  51.28 
 
 		 211 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  61.39 
 
 		 199 aa  123  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  51.28 
 
 		 211 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  51.28 
 
 		 211 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  50.89 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  54.46 
 
 		 163 aa  121  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  59.79 
 
 		 134 aa  120  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  61.8 
 
 		 140 aa  120  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  54.74 
 
 		 239 aa  120  7e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  55.79 
 
 		 270 aa  120  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  42.68 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  54.08 
 
 		 279 aa  118  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  65.52 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  53.15 
 
 		 238 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  64.37 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  60 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 121 aa  117  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  53.92 
 
 		 170 aa  117  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  73.97 
 
 		 121 aa  117  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  55.26 
 
 		 200 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  50.45 
 
 		 202 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  58.51 
 
 		 367 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  65.12 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  61.29 
 
 		 200 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  53.92 
 
 		 163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  58.33 
 
 		 303 aa  114  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  60.22 
 
 		 124 aa  113  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  53.26 
 
 		 270 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  61.8 
 
 		 212 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  51.46 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  52.63 
 
 		 243 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  59.34 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  49.55 
 
 		 203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  49.55 
 
 		 213 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  59.34 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  49.55 
 
 		 213 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  55 
 
 		 171 aa  111  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  55.21 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  47.75 
 
 		 203 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  48.65 
 
 		 214 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  57.61 
 
 		 123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 265 aa  111  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  38.65 
 
 		 286 aa  111  5e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  47.75 
 
 		 203 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  53.12 
 
 		 240 aa  110  6e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  40.26 
 
 		 324 aa  110  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  54.26 
 
 		 254 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  53.61 
 
 		 217 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  58.06 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  51.58 
 
 		 264 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  57.45 
 
 		 370 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  57.29 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  54 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 321 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  50 
 
 		 214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  47.92 
 
 		 260 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  55.06 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  50.42 
 
 		 238 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 322 aa  108  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2221  rare lipoprotein A-like protein  49.49 
 
 		 249 aa  107  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  56.18 
 
 		 342 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  62.64 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  62.64 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  41.25 
 
 		 186 aa  107  7.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  47.25 
 
 		 264 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 339 aa  107  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 115 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  52.63 
 
 		 120 aa  107  9.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  61.63 
 
 		 213 aa  107  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  51.46 
 
 		 249 aa  106  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  60.47 
 
 		 261 aa  106  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 293 aa  106  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  51.58 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 179 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  51.11 
 
 		 270 aa  106  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  56.18 
 
 		 341 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>