More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1988 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  100 
 
 
286 aa  586  1e-166  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  78.26 
 
 
270 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  57.32 
 
 
239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  50.36 
 
 
240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  51.15 
 
 
264 aa  251  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  48.46 
 
 
279 aa  249  3e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  47.57 
 
 
270 aa  245  6e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  55.33 
 
 
275 aa  239  5e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  55.33 
 
 
266 aa  239  5e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  55.33 
 
 
275 aa  239  5e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  39.16 
 
 
249 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  40.56 
 
 
325 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  40.64 
 
 
254 aa  155  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  38.84 
 
 
342 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  38.43 
 
 
342 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  37.91 
 
 
243 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  39.48 
 
 
322 aa  151  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  37.41 
 
 
259 aa  148  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  58.77 
 
 
238 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  45.86 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  55.73 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  38.89 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  40.17 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  38.49 
 
 
341 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  44 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  36.47 
 
 
332 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  48.08 
 
 
258 aa  145  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  38.27 
 
 
342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  62.16 
 
 
260 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  53.78 
 
 
259 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
321 aa  142  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  43.3 
 
 
265 aa  142  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  38.25 
 
 
333 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  38.25 
 
 
333 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  37.87 
 
 
335 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  43.46 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  35.95 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  35.37 
 
 
337 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
322 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  37.96 
 
 
323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  35.34 
 
 
331 aa  139  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  57.26 
 
 
267 aa  136  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  41.33 
 
 
297 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  52.31 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  36.04 
 
 
282 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  36.13 
 
 
269 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  55.65 
 
 
283 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  54.87 
 
 
281 aa  133  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  40.91 
 
 
284 aa  133  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  39.55 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  45.32 
 
 
324 aa  132  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  59.46 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  52.89 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  53.04 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  53.04 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  53.04 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  53.04 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  37.01 
 
 
339 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  53.28 
 
 
391 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  44 
 
 
367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  44.51 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  52.1 
 
 
394 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  52.76 
 
 
267 aa  129  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  58.56 
 
 
273 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  46.94 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  34.95 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  35.38 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  55.75 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  43.93 
 
 
424 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  57.26 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  53.15 
 
 
290 aa  125  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  54.37 
 
 
358 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  34.21 
 
 
381 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  31.27 
 
 
318 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  62.37 
 
 
342 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  49.59 
 
 
260 aa  123  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  50 
 
 
341 aa  123  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  36.29 
 
 
333 aa  122  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  53.98 
 
 
382 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  52.94 
 
 
419 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  42.53 
 
 
421 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  50.88 
 
 
408 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  45.86 
 
 
281 aa  120  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  49.12 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  50.44 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  37.85 
 
 
314 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  52.21 
 
 
286 aa  118  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1538  rare lipoprotein A  49.56 
 
 
383 aa  118  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.516723  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  50.41 
 
 
160 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  40.28 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  46.51 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  53.15 
 
 
160 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  37.36 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  48.67 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  37.36 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>