More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2271 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  100 
 
 		 120 aa  246  9e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0046  rare lipoprotein A  59.17 
 
 		 120 aa  156  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0038  putative lipoprotein A  57.38 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  59.14 
 
 		 360 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  59.14 
 
 		 360 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  59.14 
 
 		 342 aa  120  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 358 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  62.92 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  56.12 
 
 		 212 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  65 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  59.09 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  56 
 
 		 262 aa  115  3e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  62.64 
 
 		 270 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  54.29 
 
 		 239 aa  113  6.9999999999999995e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  59.09 
 
 		 121 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  65.79 
 
 		 324 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  55.43 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  55.1 
 
 		 238 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  52.58 
 
 		 200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 335 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  56.52 
 
 		 297 aa  110  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  56.52 
 
 		 270 aa  110  9e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  54.35 
 
 		 286 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  53.06 
 
 		 260 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  52.13 
 
 		 246 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  51.55 
 
 		 200 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 259 aa  108  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  48.15 
 
 		 279 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  46.03 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  67.11 
 
 		 240 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  52.63 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  58.23 
 
 		 323 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 265 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  69.44 
 
 		 181 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 275 aa  106  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 265 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 145 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 221 aa  106  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 275 aa  106  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  49.53 
 
 		 124 aa  105  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 266 aa  106  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 264 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 264 aa  106  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  53.06 
 
 		 339 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  57.65 
 
 		 199 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  50.98 
 
 		 278 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4083  rare lipoprotein A  59.74 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  63.16 
 
 		 285 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  58.44 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  51.55 
 
 		 199 aa  104  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0513  rare lipoprotein A  55.21 
 
 		 266 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.411348  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  53.47 
 
 		 125 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 196 aa  104  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  51.46 
 
 		 331 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 324 aa  104  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  53.26 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  49.19 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  54.74 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  55.79 
 
 		 163 aa  103  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 179 aa  103  7e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  59.21 
 
 		 303 aa  103  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  51.55 
 
 		 230 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 170 aa  103  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  51.55 
 
 		 211 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  51.55 
 
 		 242 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  51.55 
 
 		 242 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  51.55 
 
 		 230 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  60.53 
 
 		 238 aa  103  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  52.13 
 
 		 260 aa  103  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  51.55 
 
 		 211 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  51.55 
 
 		 211 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  51.55 
 
 		 211 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  59.74 
 
 		 254 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  54.35 
 
 		 267 aa  102  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0789  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 253 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  54.35 
 
 		 267 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  53.26 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  48.91 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  61.11 
 
 		 257 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  53.26 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 322 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 297 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  52.22 
 
 		 342 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  53.76 
 
 		 263 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  47.22 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  55.32 
 
 		 286 aa  101  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 335 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  51.65 
 
 		 322 aa  101  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  52.22 
 
 		 342 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  49.49 
 
 		 171 aa  101  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 270 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 162 aa  100  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  49.5 
 
 		 282 aa  100  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>