More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1081 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  100 
 
 		 270 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  47.57 
 
 		 286 aa  251  6e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  46.4 
 
 		 270 aa  246  3e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  52.32 
 
 		 239 aa  242  3.9999999999999997e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  46.82 
 
 		 264 aa  239  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  52.94 
 
 		 279 aa  228  8e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  46.82 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  46.91 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  46.91 
 
 		 275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  46.91 
 
 		 275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  41.2 
 
 		 249 aa  162  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  38.11 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  38.84 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  48.19 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  41.2 
 
 		 259 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  43.98 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  48.28 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  48.47 
 
 		 265 aa  142  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  46.29 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  35.14 
 
 		 260 aa  139  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  54.14 
 
 		 260 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  39.36 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  38.79 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  56.35 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  63.92 
 
 		 342 aa  136  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  45.68 
 
 		 321 aa  135  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  41.9 
 
 		 267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  36.82 
 
 		 324 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  44.62 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  40.55 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  44.03 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  42.5 
 
 		 263 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  67.03 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  65.93 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  47.1 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  43.71 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  42.11 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  43.02 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  52.27 
 
 		 297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  43.02 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  43.02 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  43.02 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  45.03 
 
 		 331 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  52.71 
 
 		 283 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  46.45 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  36.71 
 
 		 295 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  57.27 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  43.5 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  33.33 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  50.39 
 
 		 342 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  53.91 
 
 		 339 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  56.36 
 
 		 335 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  31.31 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  49.24 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  50.39 
 
 		 342 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  44.52 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  53.77 
 
 		 358 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  53.57 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  59.78 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  44.81 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  41.45 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  59.78 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  55.45 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0513  rare lipoprotein A  52.73 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.411348  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  32.58 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0789  rare lipoprotein A  37.76 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  52.42 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  49.64 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  52.42 
 
 		 280 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  33.04 
 
 		 408 aa  122  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  46.09 
 
 		 367 aa  122  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  56.31 
 
 		 242 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  52.21 
 
 		 391 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  52.21 
 
 		 394 aa  122  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  56.31 
 
 		 242 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  53.64 
 
 		 333 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  56.31 
 
 		 211 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  53.64 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  56.31 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  56.31 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  56.31 
 
 		 211 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  41.18 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  39.04 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  56.31 
 
 		 211 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  40.44 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  40.44 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  56.31 
 
 		 211 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  44.06 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  55.79 
 
 		 157 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  59.14 
 
 		 163 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  58.51 
 
 		 181 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  42.77 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  52.73 
 
 		 367 aa  119  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  47.62 
 
 		 318 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  37.95 
 
 		 315 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  49.55 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  45.58 
 
 		 186 aa  119  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  45.67 
 
 		 364 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 170 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  50.86 
 
 		 424 aa  118  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>