More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4315 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  93 
 
 		 200 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  67 
 
 		 199 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  58.02 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  58.02 
 
 		 211 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  58.02 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  58.02 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  58.02 
 
 		 211 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  58.02 
 
 		 211 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  58.02 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  57.08 
 
 		 211 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  55.94 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  56.16 
 
 		 203 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  56.16 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  54.68 
 
 		 213 aa  208  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  54.19 
 
 		 203 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  54.19 
 
 		 213 aa  204  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  69.03 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  40 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3267  putative lipoprotein  44.62 
 
 		 234 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  42.05 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  54.14 
 
 		 175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  44.81 
 
 		 267 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  51.15 
 
 		 260 aa  131  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  52.88 
 
 		 293 aa  131  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  38.17 
 
 		 264 aa  131  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  41.62 
 
 		 297 aa  131  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  41.04 
 
 		 263 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 227 aa  130  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  56.64 
 
 		 391 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  41.57 
 
 		 278 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3465  rare lipoprotein A  42.63 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  40.31 
 
 		 267 aa  129  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  58.25 
 
 		 265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  64.84 
 
 		 360 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  64.84 
 
 		 360 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  55.77 
 
 		 337 aa  128  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  35.92 
 
 		 269 aa  128  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  45.4 
 
 		 408 aa  127  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  60.4 
 
 		 331 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  62 
 
 		 381 aa  127  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  37.7 
 
 		 281 aa  127  9.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3137  rare lipoprotein A  41.15 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  63.83 
 
 		 421 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  63.83 
 
 		 419 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  41.15 
 
 		 424 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  56.44 
 
 		 342 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  44.58 
 
 		 342 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  52.17 
 
 		 342 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  56.44 
 
 		 335 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  60.2 
 
 		 342 aa  126  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  44.58 
 
 		 341 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  69.89 
 
 		 121 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  52.99 
 
 		 206 aa  124  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  52.1 
 
 		 325 aa  124  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  38.64 
 
 		 277 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  38.64 
 
 		 277 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  63.54 
 
 		 124 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  44.13 
 
 		 286 aa  124  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  57.01 
 
 		 367 aa  124  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  65.59 
 
 		 121 aa  124  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  39.33 
 
 		 277 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  57.73 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  59.38 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  53.27 
 
 		 332 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  53.27 
 
 		 333 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  52.34 
 
 		 333 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  52.25 
 
 		 260 aa  123  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  53.27 
 
 		 333 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0789  rare lipoprotein A  51.24 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  38.69 
 
 		 323 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  37.78 
 
 		 281 aa  123  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  38.76 
 
 		 277 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  62.5 
 
 		 124 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  53.7 
 
 		 310 aa  122  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  54.46 
 
 		 259 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  65.59 
 
 		 121 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 311 aa  122  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  52.25 
 
 		 270 aa  122  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  68.13 
 
 		 94 aa  121  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  59.8 
 
 		 230 aa  121  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  58.1 
 
 		 324 aa  121  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  36.56 
 
 		 322 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  62.11 
 
 		 285 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  57.29 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  53.4 
 
 		 280 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  53.4 
 
 		 280 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  53.4 
 
 		 280 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  58 
 
 		 471 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  54 
 
 		 257 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  42.61 
 
 		 155 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  60 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  59 
 
 		 335 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  61.46 
 
 		 124 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 364 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  48.41 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  55 
 
 		 321 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>