More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3528 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  100 
 
 		 331 aa  657    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  52.73 
 
 		 409 aa  339  5e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  77.3 
 
 		 391 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  39.72 
 
 		 381 aa  206  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  41.75 
 
 		 333 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  40.87 
 
 		 394 aa  199  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  51.85 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  36.83 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  44.96 
 
 		 324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  39.33 
 
 		 286 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  36.95 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  48.28 
 
 		 278 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  48.59 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  44.2 
 
 		 264 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  46.86 
 
 		 260 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  48.33 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  43.65 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  46.63 
 
 		 322 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  36.04 
 
 		 332 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  37.92 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  36.13 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  47.46 
 
 		 267 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  36.18 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  35.94 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  39.62 
 
 		 290 aa  156  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  39.16 
 
 		 295 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  47.83 
 
 		 265 aa  155  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  34.64 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  34.34 
 
 		 342 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  36.56 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  35.93 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  39.93 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  49.66 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  36.99 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  34.78 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  44.94 
 
 		 270 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  36.92 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  33.22 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  36.92 
 
 		 333 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  33.01 
 
 		 311 aa  149  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  35.59 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  50 
 
 		 269 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  40.58 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  36.07 
 
 		 286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  35.31 
 
 		 325 aa  145  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  40 
 
 		 277 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  48.63 
 
 		 263 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  33.63 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  40 
 
 		 277 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  39.61 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  40.66 
 
 		 281 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  48.1 
 
 		 280 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  48.1 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  47.47 
 
 		 283 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  48.1 
 
 		 280 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  33 
 
 		 261 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  33 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  48.48 
 
 		 471 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  57.02 
 
 		 254 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  39.62 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  38.89 
 
 		 282 aa  136  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  53.97 
 
 		 273 aa  135  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  44.02 
 
 		 417 aa  135  8e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  53.97 
 
 		 273 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  37.07 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  43.41 
 
 		 415 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  48.03 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  38.44 
 
 		 408 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  52.24 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  33.47 
 
 		 239 aa  134  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  29.63 
 
 		 279 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  57.73 
 
 		 206 aa  132  9e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  57.73 
 
 		 206 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  41.18 
 
 		 281 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  36.56 
 
 		 246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  60.4 
 
 		 200 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  33.2 
 
 		 240 aa  127  3e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  45.32 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  51.72 
 
 		 270 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  45.32 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  45.32 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  58.42 
 
 		 200 aa  126  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  36.44 
 
 		 259 aa  126  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  49.63 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  46.24 
 
 		 424 aa  125  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  48.89 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  43.6 
 
 		 258 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  50.37 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  32.3 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  46.32 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  63.16 
 
 		 212 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  34.96 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  50.38 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  51.33 
 
 		 259 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  31.68 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  33.8 
 
 		 339 aa  123  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  54.46 
 
 		 211 aa  123  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  42.7 
 
 		 364 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>