More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0513 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0513  rare lipoprotein A  100 
 
 		 266 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.411348  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  40.11 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  41.99 
 
 		 217 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  44.64 
 
 		 242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  44.64 
 
 		 242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  44.64 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  44.64 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  44.64 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  44.64 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  44.05 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  52.73 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  48.33 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  46.77 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  42.86 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  60 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  60 
 
 		 391 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  54.17 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  44.2 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  57.29 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  55.79 
 
 		 200 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  56.52 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  57.29 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  45.24 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  46.03 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  48.67 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  46.03 
 
 		 203 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  44.92 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  57.58 
 
 		 166 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  53.68 
 
 		 200 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 203 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 203 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  61.29 
 
 		 168 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  46.28 
 
 		 202 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  36.52 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  54.46 
 
 		 310 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  57.14 
 
 		 341 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  52.13 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 381 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  57.14 
 
 		 342 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  50.45 
 
 		 331 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  39.88 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  45.97 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  53.47 
 
 		 181 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  55.67 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  51.58 
 
 		 170 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 199 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  59.14 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  39.08 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  41.84 
 
 		 322 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  46.34 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  44.35 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  53.06 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  46.61 
 
 		 163 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  49.09 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  55.79 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  43.41 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  48.72 
 
 		 258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  37.14 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  39.44 
 
 		 322 aa  109  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  42.36 
 
 		 249 aa  109  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  54.64 
 
 		 394 aa  109  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  54.35 
 
 		 286 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  49.12 
 
 		 285 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 358 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  48.62 
 
 		 163 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  51.46 
 
 		 352 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  41.96 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  50 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  53.26 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  45.76 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  45.76 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  48.54 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  50.41 
 
 		 165 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  54.17 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0789  rare lipoprotein A  39.74 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  52.38 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  46.74 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  52.75 
 
 		 163 aa  106  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  44.55 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  56.38 
 
 		 238 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  46.74 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  46.74 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  46.74 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  46.74 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  57.3 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  43.85 
 
 		 417 aa  105  6e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  54.44 
 
 		 142 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  50.55 
 
 		 297 aa  105  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  55.21 
 
 		 120 aa  105  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 360 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 175 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  53.85 
 
 		 360 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>