More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5161 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  100 
 
 		 391 aa  764    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  48.91 
 
 		 409 aa  290  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  77.16 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  39.38 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  37.84 
 
 		 381 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  50.83 
 
 		 310 aa  182  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  51.35 
 
 		 278 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  51.43 
 
 		 264 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  38.27 
 
 		 324 aa  176  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  34.34 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  52 
 
 		 265 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  35.44 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  57.14 
 
 		 230 aa  173  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  34.18 
 
 		 333 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  34.27 
 
 		 333 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  33.93 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  50.57 
 
 		 333 aa  171  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  55.7 
 
 		 286 aa  171  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  51.16 
 
 		 267 aa  170  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  35.07 
 
 		 342 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  35.32 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  52.12 
 
 		 265 aa  168  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  51.4 
 
 		 297 aa  167  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  51.74 
 
 		 267 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  51.34 
 
 		 323 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  51.23 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  36.36 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  57.04 
 
 		 260 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  48.24 
 
 		 322 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  42.92 
 
 		 260 aa  159  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  48.63 
 
 		 342 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  47.16 
 
 		 293 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  49.74 
 
 		 337 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  53.57 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  47.62 
 
 		 270 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  57.66 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  50.31 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  50.36 
 
 		 277 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  50.36 
 
 		 277 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  50.36 
 
 		 277 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  50.36 
 
 		 277 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 281 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  52.55 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  56.06 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  52.55 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  52.55 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  52.55 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  34.6 
 
 		 415 aa  149  6e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  34.13 
 
 		 325 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  53.79 
 
 		 285 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  38.8 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  59.83 
 
 		 254 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  58.62 
 
 		 273 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  58.62 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  50.35 
 
 		 423 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  45.56 
 
 		 311 aa  143  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  50.31 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  38.68 
 
 		 264 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  31.72 
 
 		 370 aa  139  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  45.51 
 
 		 258 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  55.08 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  47.56 
 
 		 284 aa  138  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  45.4 
 
 		 471 aa  137  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  53.38 
 
 		 257 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  43.71 
 
 		 261 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  43.71 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  48.68 
 
 		 352 aa  134  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  56.64 
 
 		 200 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  55.26 
 
 		 259 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  57.73 
 
 		 206 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2966  rare lipoprotein A  32.44 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  64.21 
 
 		 212 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  53.28 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  54.87 
 
 		 200 aa  131  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  57.73 
 
 		 206 aa  131  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  44.09 
 
 		 408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  52.59 
 
 		 282 aa  130  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  41.51 
 
 		 314 aa  130  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  58.18 
 
 		 255 aa  130  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  31.85 
 
 		 375 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  52.1 
 
 		 246 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  53.04 
 
 		 270 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  45.14 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  56.64 
 
 		 322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  41.76 
 
 		 275 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  41.76 
 
 		 275 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  53.45 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  51.72 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  46.98 
 
 		 238 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  44.57 
 
 		 474 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  30.92 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  53.7 
 
 		 160 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  53.7 
 
 		 160 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  44.57 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  30.97 
 
 		 367 aa  127  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  36.16 
 
 		 424 aa  126  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  52.1 
 
 		 266 aa  126  7e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  31.81 
 
 		 360 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  55.24 
 
 		 211 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  51.52 
 
 		 259 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>