More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1244 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  100 
 
 		 409 aa  810    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  68.54 
 
 		 331 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  65.03 
 
 		 391 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  37.03 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  39.49 
 
 		 381 aa  196  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  48.94 
 
 		 310 aa  187  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  48.73 
 
 		 230 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  52.49 
 
 		 286 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  32.15 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  47.98 
 
 		 297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  44.02 
 
 		 278 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  43.46 
 
 		 322 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  46.59 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  46.59 
 
 		 277 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  46.59 
 
 		 277 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  46.59 
 
 		 277 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  43.82 
 
 		 264 aa  159  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  46.96 
 
 		 297 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  45.51 
 
 		 281 aa  156  7e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  31.07 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  42.08 
 
 		 265 aa  153  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  49.7 
 
 		 285 aa  153  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  33.44 
 
 		 321 aa  152  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  32.28 
 
 		 341 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  50.37 
 
 		 260 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  43.01 
 
 		 333 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  40.62 
 
 		 333 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  52.21 
 
 		 280 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  52.21 
 
 		 280 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  52.21 
 
 		 280 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  52.21 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  29.84 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  32.98 
 
 		 324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  45.24 
 
 		 295 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  47.83 
 
 		 265 aa  146  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  34.68 
 
 		 415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  40.88 
 
 		 260 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  41.38 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  46.21 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  42.92 
 
 		 471 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  31.84 
 
 		 342 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  49.63 
 
 		 342 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  49.63 
 
 		 342 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  45.32 
 
 		 263 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  40 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  46.38 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  44.67 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  40.83 
 
 		 269 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  40.57 
 
 		 267 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  52.31 
 
 		 273 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  43.98 
 
 		 337 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  40 
 
 		 267 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  46.67 
 
 		 273 aa  137  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  48.78 
 
 		 254 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  47.01 
 
 		 293 aa  134  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  48.85 
 
 		 257 aa  133  6.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  48.2 
 
 		 325 aa  132  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  39.55 
 
 		 311 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  50.43 
 
 		 206 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  50.43 
 
 		 206 aa  130  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  32.59 
 
 		 281 aa  129  8.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  47.79 
 
 		 243 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  36.86 
 
 		 352 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  63.74 
 
 		 212 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  43.97 
 
 		 259 aa  126  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  48.31 
 
 		 246 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  29.26 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  39.49 
 
 		 258 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  40.56 
 
 		 314 aa  124  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  49.14 
 
 		 282 aa  123  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  38.77 
 
 		 398 aa  123  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  43.02 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  37.38 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  50 
 
 		 200 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  42.11 
 
 		 238 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1538  rare lipoprotein A  39.66 
 
 		 383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.516723  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  52.1 
 
 		 283 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  50 
 
 		 200 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  45 
 
 		 264 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  50.47 
 
 		 242 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  50.47 
 
 		 242 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  50.47 
 
 		 230 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  50.47 
 
 		 211 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  50.47 
 
 		 211 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  38.73 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  50.47 
 
 		 211 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  48.15 
 
 		 312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  50.47 
 
 		 230 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  50.47 
 
 		 211 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  35.53 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  35.47 
 
 		 474 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  28.1 
 
 		 360 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  38.12 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  41.71 
 
 		 408 aa  117  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  48.89 
 
 		 315 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  61.96 
 
 		 238 aa  116  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  38.67 
 
 		 265 aa  116  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  53.19 
 
 		 202 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  38.67 
 
 		 261 aa  116  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>