More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1579 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  100 
 
 		 408 aa  828    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  48.11 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  51.15 
 
 		 421 aa  338  7e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  50.77 
 
 		 419 aa  335  7.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  48.65 
 
 		 346 aa  272  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  59.62 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  58.69 
 
 		 364 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  56.65 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  62.78 
 
 		 315 aa  232  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  56.74 
 
 		 312 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  64.29 
 
 		 283 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  57.59 
 
 		 314 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  54.02 
 
 		 312 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  43.89 
 
 		 281 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  57 
 
 		 279 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  63.25 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  53.95 
 
 		 341 aa  206  8e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  49.81 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1538  rare lipoprotein A  59.52 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.516723  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  47.81 
 
 		 468 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  46.93 
 
 		 474 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  46.49 
 
 		 455 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  52.24 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  48.87 
 
 		 398 aa  193  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  49.07 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  63.85 
 
 		 339 aa  179  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  51.25 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  57.5 
 
 		 367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  48.95 
 
 		 341 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  48.95 
 
 		 342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  49.08 
 
 		 322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  51.22 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  47.46 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  45.3 
 
 		 278 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  57.85 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  36.25 
 
 		 342 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  57.02 
 
 		 333 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  57.02 
 
 		 333 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  36.44 
 
 		 342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  57.76 
 
 		 335 aa  137  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  54.1 
 
 		 265 aa  137  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  43.18 
 
 		 267 aa  137  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  45.6 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  57.76 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  55.37 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  57.5 
 
 		 381 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  40.88 
 
 		 267 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  46.03 
 
 		 224 aa  133  5e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  37.65 
 
 		 322 aa  133  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  39.15 
 
 		 242 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  39.15 
 
 		 242 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  57.89 
 
 		 423 aa  133  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  39.15 
 
 		 230 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  53.51 
 
 		 263 aa  132  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  55.46 
 
 		 259 aa  132  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  39.15 
 
 		 211 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  39.15 
 
 		 211 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  39.15 
 
 		 211 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  53.04 
 
 		 269 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  42.63 
 
 		 297 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  54.1 
 
 		 265 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0482  rare lipoprotein A  55.66 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.241212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  38.62 
 
 		 230 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  53.73 
 
 		 471 aa  130  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  52.46 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  46.47 
 
 		 415 aa  130  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  45.88 
 
 		 417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  61.76 
 
 		 286 aa  129  9.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  38.12 
 
 		 394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  40.11 
 
 		 275 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  40.11 
 
 		 275 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  43.72 
 
 		 295 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  60.95 
 
 		 200 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  55.77 
 
 		 211 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  45.4 
 
 		 200 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  49.7 
 
 		 331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  50 
 
 		 324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  44.81 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  51.67 
 
 		 282 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  52.99 
 
 		 202 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  49.24 
 
 		 254 aa  126  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  41.24 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  50.36 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  51.64 
 
 		 260 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  40.34 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  53.1 
 
 		 214 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  52.99 
 
 		 203 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  52.99 
 
 		 203 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  53.1 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  43.16 
 
 		 270 aa  124  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  58.41 
 
 		 391 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  51.33 
 
 		 203 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  42.51 
 
 		 259 aa  123  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  51.75 
 
 		 270 aa  122  8e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  51.56 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  44.63 
 
 		 230 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  55.75 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  37.78 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  59.14 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  51.28 
 
 		 213 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>