More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0928 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  100 
 
 
206 aa  417  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  97.09 
 
 
206 aa  386  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  60.77 
 
 
198 aa  211  5.999999999999999e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  53.28 
 
 
203 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  52.9 
 
 
202 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  53.28 
 
 
213 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  55.47 
 
 
214 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  54.69 
 
 
203 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  62.63 
 
 
211 aa  142  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  54.69 
 
 
203 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  44.44 
 
 
211 aa  141  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  44.44 
 
 
242 aa  141  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  44.44 
 
 
211 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  44.44 
 
 
211 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  44.44 
 
 
230 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  44.44 
 
 
242 aa  141  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  44.44 
 
 
230 aa  141  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  59.38 
 
 
257 aa  139  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  52.55 
 
 
213 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  40.98 
 
 
342 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  40.98 
 
 
341 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  60 
 
 
310 aa  135  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  59.41 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  55.79 
 
 
297 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  58.59 
 
 
273 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  59.14 
 
 
286 aa  132  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  57.29 
 
 
337 aa  132  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  57.73 
 
 
331 aa  131  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  47.62 
 
 
409 aa  131  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3267  rare lipoprotein A  58.33 
 
 
247 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  55.34 
 
 
325 aa  131  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  57.58 
 
 
273 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  58.59 
 
 
270 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3267  putative lipoprotein  59.38 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  61.86 
 
 
199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  56.25 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  57.29 
 
 
394 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3137  rare lipoprotein A  58.33 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  55.21 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  55.79 
 
 
332 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  56.25 
 
 
267 aa  128  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  49.18 
 
 
297 aa  128  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  51.26 
 
 
312 aa  128  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  55.79 
 
 
333 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  57.29 
 
 
251 aa  128  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  55.79 
 
 
333 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  57.73 
 
 
391 aa  127  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  53.85 
 
 
278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  55.79 
 
 
322 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  59.79 
 
 
279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  53.4 
 
 
381 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  56 
 
 
323 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  57.29 
 
 
295 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  54.46 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  55.21 
 
 
293 aa  126  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  54.37 
 
 
333 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  52.94 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  55.21 
 
 
267 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  35.64 
 
 
230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  51.89 
 
 
324 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  55.79 
 
 
335 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  51.97 
 
 
200 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  55.67 
 
 
290 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  48.65 
 
 
282 aa  125  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  51.96 
 
 
264 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  52.94 
 
 
260 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3465  rare lipoprotein A  56.25 
 
 
250 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  52.99 
 
 
200 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  56.7 
 
 
254 aa  125  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  56.25 
 
 
227 aa  124  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  57.29 
 
 
312 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  51 
 
 
283 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  52.08 
 
 
342 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  52.08 
 
 
342 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  59.14 
 
 
367 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
321 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  51.58 
 
 
280 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  53.68 
 
 
333 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  52.94 
 
 
265 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  55.91 
 
 
335 aa  123  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  61.54 
 
 
217 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  51.58 
 
 
280 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  51.58 
 
 
280 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  58.33 
 
 
281 aa  122  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  60 
 
 
358 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  55.21 
 
 
339 aa  122  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  58.7 
 
 
423 aa  122  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  61.54 
 
 
171 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  49 
 
 
277 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  49 
 
 
277 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  49 
 
 
277 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  49 
 
 
277 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  49.47 
 
 
281 aa  122  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  56.31 
 
 
214 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  46.67 
 
 
186 aa  121  6e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  51.49 
 
 
260 aa  121  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  52.78 
 
 
471 aa  121  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  58.33 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  50.42 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  54.64 
 
 
314 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>