More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1548 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  100 
 
 		 290 aa  590  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  45.39 
 
 		 311 aa  237  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  44.55 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  41.28 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  41.22 
 
 		 265 aa  223  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  40 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  40.21 
 
 		 278 aa  219  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  45.88 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  42.12 
 
 		 260 aa  216  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  39.54 
 
 		 277 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  43.01 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  37.02 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  37.02 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  37.02 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  41.05 
 
 		 332 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  40.68 
 
 		 280 aa  211  9e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  40.68 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  40.15 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  40.68 
 
 		 280 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  36.82 
 
 		 281 aa  210  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  38.68 
 
 		 293 aa  208  9e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  48.22 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  42.51 
 
 		 333 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  42.46 
 
 		 333 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  38.31 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  39.81 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  41.73 
 
 		 342 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  41.81 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  41.73 
 
 		 342 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  38.77 
 
 		 342 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  38.2 
 
 		 337 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  38 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  36.4 
 
 		 269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  41.3 
 
 		 335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  38.01 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  37.46 
 
 		 267 aa  195  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  38.58 
 
 		 297 aa  193  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  38.41 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  40.33 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  38.41 
 
 		 265 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  37.68 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  40.96 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  36.31 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  39.54 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  37.72 
 
 		 284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  39.93 
 
 		 325 aa  182  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  39.16 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  44.94 
 
 		 286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  35.07 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  37.84 
 
 		 352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  48.63 
 
 		 417 aa  172  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  51.27 
 
 		 415 aa  171  9e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  38.38 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  54.25 
 
 		 423 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  38.58 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  52.98 
 
 		 471 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  41.11 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  49.7 
 
 		 394 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  37.32 
 
 		 243 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  47.73 
 
 		 391 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  40 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  37.41 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  52.21 
 
 		 381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  54.35 
 
 		 409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  36.52 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  35.89 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  46.86 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  36.36 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  42.79 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  38.46 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  57.03 
 
 		 382 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  47.88 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  41.26 
 
 		 249 aa  135  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  37 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  48.48 
 
 		 315 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  42.94 
 
 		 264 aa  132  9e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  47.88 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  42.65 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  53.17 
 
 		 455 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  47.56 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  53.17 
 
 		 474 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  53.17 
 
 		 468 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  44.32 
 
 		 398 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  52.38 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  43.29 
 
 		 270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  44.85 
 
 		 421 aa  126  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  43.56 
 
 		 286 aa  126  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  48.2 
 
 		 442 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  44.85 
 
 		 419 aa  126  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  36.44 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  55.67 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  59 
 
 		 160 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  59 
 
 		 160 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  55.67 
 
 		 206 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  43.68 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  45 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  52.07 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  48.89 
 
 		 364 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  48.89 
 
 		 364 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  49.63 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>