More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1466 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  100 
 
 
279 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  73.08 
 
 
312 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  77.73 
 
 
312 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  60.63 
 
 
315 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  62.22 
 
 
314 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  80.3 
 
 
314 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  77.78 
 
 
283 aa  332  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  63.29 
 
 
314 aa  255  7e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  60.59 
 
 
455 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  62.37 
 
 
442 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  60.1 
 
 
474 aa  237  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  60.1 
 
 
398 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  58.82 
 
 
394 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  56.68 
 
 
468 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  52.92 
 
 
346 aa  227  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  53.18 
 
 
408 aa  225  7e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  54.42 
 
 
341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  56.25 
 
 
424 aa  211  7.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  57.61 
 
 
419 aa  211  9e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  57.61 
 
 
421 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  50.75 
 
 
364 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  50.75 
 
 
364 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
382 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1538  rare lipoprotein A  60.9 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.516723  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  50.83 
 
 
339 aa  175  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  44.78 
 
 
281 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  50 
 
 
322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  56.56 
 
 
367 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  45.03 
 
 
264 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  49.36 
 
 
265 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  47.09 
 
 
322 aa  142  7e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  52.45 
 
 
335 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  46.39 
 
 
297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
333 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  52.9 
 
 
265 aa  139  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  55.56 
 
 
333 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  53.78 
 
 
224 aa  138  7.999999999999999e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  54.7 
 
 
333 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  53.12 
 
 
311 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  40 
 
 
342 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  43.37 
 
 
318 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  46.47 
 
 
260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  38.6 
 
 
342 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  47.97 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  48 
 
 
342 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  48.23 
 
 
286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  48 
 
 
341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  55.45 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  50 
 
 
254 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  41.81 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  45.51 
 
 
278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  56.88 
 
 
295 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  40.11 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  60.82 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  40.62 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  53.51 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  47.55 
 
 
324 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  49.17 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0482  rare lipoprotein A  55.66 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.241212  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  59.79 
 
 
206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  59.79 
 
 
206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  42.78 
 
 
277 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  42.78 
 
 
277 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  42.78 
 
 
277 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  40.12 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  47.37 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  50 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  40.12 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  42.22 
 
 
277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  43.79 
 
 
321 aa  126  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  31.65 
 
 
264 aa  125  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2856  rare lipoprotein A  44.97 
 
 
154 aa  125  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  51.97 
 
 
415 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  60.44 
 
 
262 aa  125  1e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  51.97 
 
 
417 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  47.73 
 
 
243 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  40.24 
 
 
266 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  52.63 
 
 
270 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  52.99 
 
 
259 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  41.3 
 
 
281 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  50.41 
 
 
333 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  42.86 
 
 
290 aa  122  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  51.75 
 
 
263 aa  122  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  48.25 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  38.89 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  52.21 
 
 
331 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  46.49 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  55.67 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  51.67 
 
 
391 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  53.57 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  59.34 
 
 
335 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  51.33 
 
 
394 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  49.12 
 
 
286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  46.62 
 
 
471 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  47.76 
 
 
381 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  46.32 
 
 
297 aa  118  9e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2087  rare lipoprotein A  53.49 
 
 
169 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  47.66 
 
 
249 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  50 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>