More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1316 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  97.12 
 
 
415 aa  822    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  100 
 
 
417 aa  847    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  44.84 
 
 
423 aa  352  5.9999999999999994e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  64.17 
 
 
471 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  61.54 
 
 
297 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  58.44 
 
 
265 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  59.86 
 
 
278 aa  176  8e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  55.17 
 
 
311 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  50.79 
 
 
295 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  58.62 
 
 
285 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  57.04 
 
 
265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  57.04 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  48.63 
 
 
290 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  55.78 
 
 
324 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  44.59 
 
 
341 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  54.9 
 
 
297 aa  171  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  54.86 
 
 
264 aa  170  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  50.54 
 
 
270 aa  169  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  56.55 
 
 
263 aa  167  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  44.49 
 
 
342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  49.5 
 
 
335 aa  166  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  56.55 
 
 
267 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  54.55 
 
 
267 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  32.06 
 
 
342 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  33.92 
 
 
342 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  54.93 
 
 
280 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  54.23 
 
 
280 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  54.23 
 
 
280 aa  160  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  53.69 
 
 
322 aa  159  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  43.78 
 
 
325 aa  159  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  43.78 
 
 
337 aa  159  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  51.02 
 
 
293 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  41.98 
 
 
281 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  55.56 
 
 
261 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  41.74 
 
 
321 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
265 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  52.82 
 
 
277 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  52.82 
 
 
277 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  52.82 
 
 
277 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  53.85 
 
 
273 aa  156  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  52.82 
 
 
277 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  52.78 
 
 
323 aa  156  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  52.82 
 
 
283 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  52.86 
 
 
332 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
333 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  44.44 
 
 
333 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  53.15 
 
 
273 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  53.02 
 
 
310 aa  152  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  54.4 
 
 
269 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  43.94 
 
 
333 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  54.84 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  50.34 
 
 
286 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  46.11 
 
 
230 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  53.52 
 
 
260 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  33.62 
 
 
381 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  47.1 
 
 
474 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  47.44 
 
 
352 aa  144  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  47.1 
 
 
455 aa  144  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  56.03 
 
 
282 aa  143  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
284 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  46.38 
 
 
409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  50.64 
 
 
333 aa  139  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  49.21 
 
 
468 aa  139  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  42.23 
 
 
421 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  42.23 
 
 
419 aa  138  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  51.43 
 
 
382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  50 
 
 
442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  45.34 
 
 
391 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  33.55 
 
 
424 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  51.49 
 
 
394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  45.78 
 
 
322 aa  134  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  49.29 
 
 
258 aa  133  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  40.72 
 
 
283 aa  133  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  36.95 
 
 
314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  40.44 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  47.02 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  39.41 
 
 
312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  45.88 
 
 
408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  42.53 
 
 
314 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  47.48 
 
 
331 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  43.23 
 
 
281 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  42.53 
 
 
318 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  47.24 
 
 
249 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  50.39 
 
 
315 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
312 aa  126  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  48.12 
 
 
314 aa  126  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  50.4 
 
 
243 aa  126  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  49.57 
 
 
254 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1538  rare lipoprotein A  40.81 
 
 
383 aa  125  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.516723  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  51.97 
 
 
279 aa  124  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  51.75 
 
 
259 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  48.91 
 
 
364 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  52.14 
 
 
367 aa  124  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  56.7 
 
 
251 aa  123  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  51.33 
 
 
246 aa  122  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  52.59 
 
 
186 aa  122  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  48.91 
 
 
364 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  31.09 
 
 
339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3267  rare lipoprotein A  53.61 
 
 
247 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  47.93 
 
 
238 aa  120  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>