More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0990 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  100 
 
 
421 aa  861    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  76.89 
 
 
424 aa  672    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  99.52 
 
 
419 aa  852    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  49.76 
 
 
408 aa  326  5e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  54.35 
 
 
346 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  61.64 
 
 
364 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  61.64 
 
 
364 aa  269  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  49.55 
 
 
382 aa  252  8.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  49.62 
 
 
315 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  51.45 
 
 
283 aa  229  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  48.58 
 
 
312 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  54.55 
 
 
341 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  48.59 
 
 
314 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  51.02 
 
 
312 aa  220  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1538  rare lipoprotein A  45.79 
 
 
383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.516723  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  52.05 
 
 
314 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  53.57 
 
 
442 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  52.05 
 
 
474 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  51.6 
 
 
455 aa  210  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  49 
 
 
468 aa  209  7e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  60.71 
 
 
279 aa  209  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  50.95 
 
 
398 aa  206  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  46.5 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  43.87 
 
 
281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  44.66 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  60.31 
 
 
339 aa  175  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
367 aa  152  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  61.79 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  60.98 
 
 
337 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  61.79 
 
 
341 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  43.63 
 
 
318 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  42.7 
 
 
322 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  45.21 
 
 
342 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  45.56 
 
 
333 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  46.41 
 
 
267 aa  143  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  45.6 
 
 
332 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  44.15 
 
 
342 aa  143  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  61.61 
 
 
335 aa  142  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  44.75 
 
 
267 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  45.56 
 
 
333 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  43.82 
 
 
297 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  44.44 
 
 
333 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  42.23 
 
 
417 aa  138  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  42.23 
 
 
415 aa  138  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0482  rare lipoprotein A  52.94 
 
 
303 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.241212  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  60 
 
 
325 aa  137  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  41.71 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  53.12 
 
 
265 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  60 
 
 
423 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  44.02 
 
 
295 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  51.56 
 
 
311 aa  133  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  39.02 
 
 
281 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  43.96 
 
 
270 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  50 
 
 
263 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  43.09 
 
 
278 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  55 
 
 
381 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  52.34 
 
 
260 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  52.34 
 
 
265 aa  130  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  39.69 
 
 
277 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  39.69 
 
 
277 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  39.69 
 
 
277 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  39.18 
 
 
277 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  50.83 
 
 
282 aa  130  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  40.72 
 
 
293 aa  129  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  53.03 
 
 
471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  54.87 
 
 
321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  40.31 
 
 
394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  50.78 
 
 
264 aa  126  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  52.46 
 
 
259 aa  127  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  63.83 
 
 
200 aa  126  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  52.38 
 
 
324 aa  126  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  49.15 
 
 
224 aa  125  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  37.5 
 
 
242 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  42.07 
 
 
269 aa  125  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  37.5 
 
 
230 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  37.5 
 
 
242 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  37.5 
 
 
230 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  48.53 
 
 
286 aa  124  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  62.77 
 
 
200 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  44.51 
 
 
290 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  37.5 
 
 
211 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  37.5 
 
 
211 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  37.5 
 
 
211 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  49.62 
 
 
280 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  49.62 
 
 
280 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  52.59 
 
 
280 aa  123  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  54.13 
 
 
203 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  46.06 
 
 
199 aa  123  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  54.13 
 
 
203 aa  123  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  38.95 
 
 
323 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  48.85 
 
 
283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  49.23 
 
 
238 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  37.37 
 
 
211 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  50.36 
 
 
259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  49.64 
 
 
243 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  53.21 
 
 
214 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  38.1 
 
 
297 aa  121  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  42.53 
 
 
286 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  44.91 
 
 
333 aa  119  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  51.47 
 
 
331 aa  119  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>