More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1165 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  100 
 
 		 283 aa  587  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  90.43 
 
 		 280 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  89.72 
 
 		 280 aa  510  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  89.72 
 
 		 280 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  80.5 
 
 		 281 aa  478  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  81.27 
 
 		 277 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  80.57 
 
 		 277 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  80.57 
 
 		 277 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  79.86 
 
 		 277 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  61.67 
 
 		 260 aa  310  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  53.71 
 
 		 265 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  54.64 
 
 		 270 aa  308  5e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  53.65 
 
 		 264 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  53.51 
 
 		 278 aa  306  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  52.35 
 
 		 297 aa  300  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  55 
 
 		 265 aa  288  8e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  43.22 
 
 		 260 aa  237  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  45.68 
 
 		 269 aa  236  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  46.61 
 
 		 263 aa  235  7e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  44.03 
 
 		 267 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  42.28 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  41.14 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  41.3 
 
 		 322 aa  217  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  40.15 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  38.32 
 
 		 321 aa  205  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  37.12 
 
 		 311 aa  195  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  41.77 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  50.81 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  35.97 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  41.28 
 
 		 285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  41.89 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  36.18 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  53.76 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  49.46 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  47.67 
 
 		 342 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  51.46 
 
 		 335 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  46.41 
 
 		 323 aa  172  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  49.73 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  40 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  47.54 
 
 		 333 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  47.54 
 
 		 333 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  45.03 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  46.99 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  48.13 
 
 		 342 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  37.96 
 
 		 243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  34.52 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  34.16 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  52.21 
 
 		 381 aa  163  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  35.29 
 
 		 333 aa  162  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  39.22 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  44.39 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  39.22 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  38.89 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  32.57 
 
 		 284 aa  159  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  52.82 
 
 		 415 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  52.82 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  47.02 
 
 		 394 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  48.94 
 
 		 352 aa  152  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  52.21 
 
 		 409 aa  152  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  53.1 
 
 		 423 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  52.55 
 
 		 391 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  51.8 
 
 		 471 aa  149  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  39.61 
 
 		 238 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  38.94 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  36.91 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  40.22 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  51.13 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  33.78 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  31.4 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  43.45 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  38.74 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  34.1 
 
 		 264 aa  135  7.000000000000001e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  55.65 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  36.28 
 
 		 259 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  38.78 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  38.58 
 
 		 194 aa  132  6.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  55.65 
 
 		 270 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  37.63 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  37.63 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  37.63 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  37.7 
 
 		 455 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  49.57 
 
 		 442 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  37.7 
 
 		 468 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  44.03 
 
 		 375 aa  129  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  48.7 
 
 		 474 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  48.89 
 
 		 279 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  52.71 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  54.78 
 
 		 382 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  51.26 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  59.78 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  59.78 
 
 		 230 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  59.78 
 
 		 230 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  40.22 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  59.78 
 
 		 242 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  59.78 
 
 		 242 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  59.78 
 
 		 211 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  35.61 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  59.78 
 
 		 211 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  59.78 
 
 		 211 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  43.36 
 
 		 240 aa  125  6e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>