More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3341 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  64.75 
 
 		 331 aa  189  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  58.27 
 
 		 409 aa  174  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 391 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  45.96 
 
 		 415 aa  145  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  46.11 
 
 		 417 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  42.86 
 
 		 278 aa  143  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  47.47 
 
 		 295 aa  142  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  48.61 
 
 		 264 aa  141  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  48.17 
 
 		 471 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  38.74 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  47.3 
 
 		 322 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  61.21 
 
 		 423 aa  139  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  53.6 
 
 		 280 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  53.6 
 
 		 280 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  53.6 
 
 		 280 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  39.89 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  52.21 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  49.31 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  50 
 
 		 342 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  37.56 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  45.4 
 
 		 324 aa  137  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  50 
 
 		 341 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  40.7 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  40.1 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  40.31 
 
 		 333 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  48.2 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  51.2 
 
 		 277 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  52.42 
 
 		 333 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  51.2 
 
 		 277 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  51.2 
 
 		 277 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  58.33 
 
 		 282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  40.2 
 
 		 342 aa  134  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  54.13 
 
 		 335 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  39.8 
 
 		 333 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  55.3 
 
 		 381 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  53.72 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  40.54 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  51.55 
 
 		 285 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  46.33 
 
 		 286 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  50.41 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  52.27 
 
 		 267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  56.07 
 
 		 321 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  43.78 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  40.74 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  41.85 
 
 		 267 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  49.62 
 
 		 337 aa  131  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  52.07 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  45.28 
 
 		 325 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  40.74 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  36.22 
 
 		 281 aa  128  9.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  51.56 
 
 		 394 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 293 aa  126  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  51.85 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  54.4 
 
 		 323 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  42.59 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  53.61 
 
 		 206 aa  124  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  40.64 
 
 		 269 aa  124  8.000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  42.59 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  42.7 
 
 		 424 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  47.79 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 367 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  53.61 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  58.25 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  49.57 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  47.33 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  56.36 
 
 		 382 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3432  rare lipoprotein A  37.13 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  44.63 
 
 		 408 aa  122  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  57.27 
 
 		 318 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  59.8 
 
 		 200 aa  121  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  37.37 
 
 		 230 aa  121  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  50 
 
 		 259 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  55.45 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  37.37 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  38.07 
 
 		 442 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  58.42 
 
 		 200 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  37.37 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  56.07 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  37.37 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  37.37 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  37.37 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  51.85 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  37.37 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  50 
 
 		 239 aa  120  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  51.75 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  48.06 
 
 		 341 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  53.21 
 
 		 364 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  52.68 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  50.91 
 
 		 160 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  50.91 
 
 		 160 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  50 
 
 		 333 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  52.78 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  51.82 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 202 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  48.31 
 
 		 186 aa  118  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  59.57 
 
 		 121 aa  118  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  54.63 
 
 		 346 aa  118  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>