More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4106 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  569  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  73.63 
 
 		 314 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  73.7 
 
 		 312 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  74.14 
 
 		 312 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  69.62 
 
 		 315 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  71.23 
 
 		 314 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  77.94 
 
 		 279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  58.94 
 
 		 314 aa  276  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  62.3 
 
 		 398 aa  234  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  57.78 
 
 		 394 aa  231  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  64.25 
 
 		 442 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  51.45 
 
 		 419 aa  229  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  63.64 
 
 		 455 aa  228  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  51.45 
 
 		 421 aa  229  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  63.1 
 
 		 468 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  63.1 
 
 		 474 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  64.29 
 
 		 408 aa  225  8e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  49.58 
 
 		 424 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  54.46 
 
 		 341 aa  214  9e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  53.04 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  65.58 
 
 		 382 aa  205  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  61.78 
 
 		 364 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  61.15 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1538  rare lipoprotein A  51.63 
 
 		 383 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.516723  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  64.12 
 
 		 339 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  61.19 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  58.2 
 
 		 367 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  51.61 
 
 		 322 aa  155  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  55.03 
 
 		 341 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  61.82 
 
 		 332 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  61.82 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  61.82 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  54.36 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  52.5 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  47.8 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  51.02 
 
 		 265 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  60 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 286 aa  142  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  45.05 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  53.28 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  54.41 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  56.1 
 
 		 337 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  53.97 
 
 		 265 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  56.91 
 
 		 325 aa  138  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  44.83 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  45.4 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  49.65 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  51.09 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  50.42 
 
 		 224 aa  136  4e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  57.26 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  48.28 
 
 		 318 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  58.72 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  41.26 
 
 		 417 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  53.51 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  45.83 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  44.13 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  54.17 
 
 		 381 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  55.75 
 
 		 394 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  45.61 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  51.75 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  45.61 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  45.61 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  50.36 
 
 		 297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  51.82 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  50.4 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  46.67 
 
 		 273 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  53.98 
 
 		 310 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  51.26 
 
 		 281 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  54.05 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  51.26 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  46.94 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  46 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  50 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  51.26 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  39.52 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  51.26 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  51.26 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  56.3 
 
 		 423 aa  126  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  49.63 
 
 		 331 aa  125  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  49.21 
 
 		 270 aa  125  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0482  rare lipoprotein A  53.77 
 
 		 303 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.241212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  49.6 
 
 		 333 aa  125  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  50.78 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  50 
 
 		 263 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  50.42 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  47.97 
 
 		 471 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  47.52 
 
 		 246 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  58.33 
 
 		 198 aa  123  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  49.21 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  50.81 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1199  rare lipoprotein A  42.35 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.670363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  51.28 
 
 		 238 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  51.64 
 
 		 259 aa  122  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  50.88 
 
 		 239 aa  122  9e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  52.14 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 335 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  48.39 
 
 		 275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2856  rare lipoprotein A  42.01 
 
 		 154 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>