More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1224 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  100 
 
 		 254 aa  526  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  49.18 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  47.11 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  43.82 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  47.9 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  45.13 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  45.29 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  44.14 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  43.26 
 
 		 275 aa  178  8e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  43.26 
 
 		 275 aa  178  8e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  46.89 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  43.26 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  39.78 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  50 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  46.19 
 
 		 240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  39.78 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  43.32 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  50.29 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  40.08 
 
 		 286 aa  159  4e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  41.94 
 
 		 270 aa  159  6e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  58.02 
 
 		 323 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  36.5 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  35.5 
 
 		 267 aa  151  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  37.45 
 
 		 260 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  36.12 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  56.12 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  41.4 
 
 		 282 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  40.38 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  39.84 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  41.94 
 
 		 278 aa  149  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  40.58 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  40.47 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  39.15 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  38.46 
 
 		 322 aa  146  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  38.27 
 
 		 311 aa  146  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  39.53 
 
 		 263 aa  145  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  40.43 
 
 		 290 aa  145  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  38.17 
 
 		 295 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  58.2 
 
 		 391 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  41.2 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  47.13 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  40.93 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  35.11 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  52.76 
 
 		 474 aa  142  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  34.72 
 
 		 260 aa  141  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  40.93 
 
 		 297 aa  141  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  44.24 
 
 		 277 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  44.24 
 
 		 277 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  41.12 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  40.65 
 
 		 273 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  43.09 
 
 		 286 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  52.76 
 
 		 455 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  48.72 
 
 		 293 aa  139  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  44.51 
 
 		 277 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  43.64 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  51.97 
 
 		 468 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  43.45 
 
 		 283 aa  138  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  56.03 
 
 		 331 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  38.32 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  38.32 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  38.32 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  55.36 
 
 		 342 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 332 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0789  rare lipoprotein A  41.75 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.206701 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  53.66 
 
 		 321 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  37.09 
 
 		 281 aa  135  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  55.36 
 
 		 342 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 333 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  57.14 
 
 		 333 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 284 aa  135  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  55.36 
 
 		 342 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  48.78 
 
 		 409 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  55.36 
 
 		 341 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  54.46 
 
 		 335 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  45.76 
 
 		 217 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  50.44 
 
 		 394 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  50.39 
 
 		 442 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  55.36 
 
 		 333 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  56.41 
 
 		 352 aa  131  9e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  42.94 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  49.61 
 
 		 394 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  44.32 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  46.26 
 
 		 314 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  50 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  48.55 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  50.79 
 
 		 325 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  53.57 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  48.46 
 
 		 471 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  51.72 
 
 		 423 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  49.24 
 
 		 408 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  48.82 
 
 		 398 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  50 
 
 		 315 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  51.85 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  33.33 
 
 		 265 aa  125  7e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  33.33 
 
 		 261 aa  125  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  56.7 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  50.42 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  49.29 
 
 		 314 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  56.12 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  49.57 
 
 		 417 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>