More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2322 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  100 
 
 
255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  49.18 
 
 
254 aa  229  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  48.84 
 
 
259 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  44.58 
 
 
249 aa  172  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  40.48 
 
 
249 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  45.5 
 
 
243 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  41.91 
 
 
259 aa  162  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  42.01 
 
 
246 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  39.91 
 
 
239 aa  154  9e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  41.78 
 
 
238 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  38.84 
 
 
270 aa  149  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  36.8 
 
 
270 aa  149  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  39.82 
 
 
258 aa  148  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  40.22 
 
 
266 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  40.22 
 
 
275 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  40.22 
 
 
275 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  34.33 
 
 
264 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  40.28 
 
 
278 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  41.47 
 
 
257 aa  142  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  36.41 
 
 
277 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  35.95 
 
 
286 aa  141  9e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  57.48 
 
 
323 aa  141  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  35.35 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  36.41 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  35.81 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  36.41 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  42.86 
 
 
285 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  30.55 
 
 
264 aa  138  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  40.31 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  35.27 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  38.82 
 
 
310 aa  136  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  36.4 
 
 
279 aa  135  5e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  36.36 
 
 
283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  38.74 
 
 
280 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  38.74 
 
 
280 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  38.74 
 
 
280 aa  135  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  40 
 
 
297 aa  135  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  46.78 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  45 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  36.02 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  34.1 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  36.89 
 
 
270 aa  132  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  33.83 
 
 
260 aa  131  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  34.57 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  34.57 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  41.8 
 
 
321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  55 
 
 
282 aa  129  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  54.55 
 
 
186 aa  128  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  41.33 
 
 
295 aa  128  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  58.18 
 
 
391 aa  128  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  35.19 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  36.02 
 
 
311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  38.96 
 
 
297 aa  125  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  41.9 
 
 
273 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  46.84 
 
 
339 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  41.34 
 
 
273 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  38.89 
 
 
263 aa  122  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  52.21 
 
 
333 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  58.33 
 
 
324 aa  122  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  51.3 
 
 
322 aa  122  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  52.21 
 
 
332 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  54.1 
 
 
367 aa  122  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  52.85 
 
 
331 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  50 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  52.1 
 
 
335 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  39.36 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  52.21 
 
 
333 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  52.21 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  36.23 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  40.22 
 
 
262 aa  119  3e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  51.79 
 
 
342 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  51.33 
 
 
341 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  51.33 
 
 
342 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  34.63 
 
 
322 aa  119  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  50.44 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  40.53 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  43.06 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  34.93 
 
 
333 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  42.47 
 
 
214 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  41.88 
 
 
171 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  45.51 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  44.08 
 
 
145 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  50.89 
 
 
337 aa  115  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  35.71 
 
 
267 aa  115  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  33.81 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  57.69 
 
 
124 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  55.43 
 
 
206 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  55.91 
 
 
171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  55.43 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  51.28 
 
 
381 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  56.73 
 
 
124 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  50 
 
 
325 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  48.74 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  50.44 
 
 
394 aa  112  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  51.04 
 
 
198 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  40.88 
 
 
163 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  44.59 
 
 
124 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  57.3 
 
 
150 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  54.08 
 
 
181 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  55.21 
 
 
122 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>