More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0215 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  100 
 
 
171 aa  353  5e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  59.06 
 
 
163 aa  209  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  53.94 
 
 
171 aa  174  7e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  48.54 
 
 
150 aa  157  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  51.72 
 
 
163 aa  149  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  63.46 
 
 
165 aa  143  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  70.65 
 
 
170 aa  140  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  71.74 
 
 
139 aa  135  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  64.95 
 
 
211 aa  130  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  63.92 
 
 
242 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  63.92 
 
 
242 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  63.92 
 
 
211 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  63.92 
 
 
230 aa  129  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  63.92 
 
 
211 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  63.92 
 
 
211 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  63.92 
 
 
230 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  64.13 
 
 
128 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  63.74 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  61.76 
 
 
142 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  67.03 
 
 
324 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  61.54 
 
 
206 aa  122  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  63.33 
 
 
360 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  63.33 
 
 
360 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  61.54 
 
 
206 aa  121  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  62.92 
 
 
124 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  59.34 
 
 
124 aa  120  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  66.29 
 
 
335 aa  120  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  62.11 
 
 
199 aa  120  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
114 aa  120  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  50.38 
 
 
166 aa  120  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  57.73 
 
 
339 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  61.54 
 
 
124 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  59.6 
 
 
370 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  57.78 
 
 
269 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  46.1 
 
 
181 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  63.64 
 
 
140 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  52.43 
 
 
259 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  40.13 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  52.42 
 
 
367 aa  119  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  58.16 
 
 
243 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  56.7 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  61.8 
 
 
124 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  57.73 
 
 
202 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  56.7 
 
 
203 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  64.04 
 
 
358 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  61.54 
 
 
155 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  46.51 
 
 
239 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  59.34 
 
 
263 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  56.7 
 
 
214 aa  117  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
163 aa  117  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  60.44 
 
 
124 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  56.7 
 
 
203 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  55.43 
 
 
186 aa  117  7.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  55.91 
 
 
332 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  41.88 
 
 
255 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  54.64 
 
 
408 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  56.7 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
142 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  54.13 
 
 
254 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  50.5 
 
 
281 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  55.91 
 
 
265 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  56.7 
 
 
213 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  57.3 
 
 
341 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  58.43 
 
 
342 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  59.55 
 
 
200 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  61.36 
 
 
134 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  40.72 
 
 
275 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  58.33 
 
 
259 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  57.29 
 
 
246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  59.55 
 
 
367 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1543  rare lipoprotein A  55.45 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  57.61 
 
 
127 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  44.68 
 
 
249 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  40.72 
 
 
275 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  46.67 
 
 
282 aa  115  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  54.08 
 
 
286 aa  114  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  58.24 
 
 
212 aa  114  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  57.14 
 
 
278 aa  114  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  43.71 
 
 
162 aa  114  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  56.04 
 
 
333 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  56.04 
 
 
333 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  54.35 
 
 
260 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  55.43 
 
 
167 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  47.29 
 
 
249 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  55.79 
 
 
266 aa  114  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  59.55 
 
 
200 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  53.77 
 
 
314 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  44.53 
 
 
424 aa  114  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  60.87 
 
 
324 aa  114  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  57.14 
 
 
122 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  52.53 
 
 
335 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  58.33 
 
 
196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  54.81 
 
 
199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  56.38 
 
 
285 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  56.12 
 
 
323 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  58.43 
 
 
260 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  56.04 
 
 
337 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  51 
 
 
342 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  55.32 
 
 
311 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  53.26 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>