More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0531 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  100 
 
 		 370 aa  746    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  59.8 
 
 		 286 aa  129  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  57.94 
 
 		 322 aa  125  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  49.61 
 
 		 261 aa  123  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  36.04 
 
 		 324 aa  123  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  53.57 
 
 		 265 aa  122  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  55.32 
 
 		 150 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  65.17 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  61.29 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  52.68 
 
 		 265 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  54.9 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  59.6 
 
 		 171 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  63.33 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  52.68 
 
 		 264 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  50 
 
 		 163 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  60.87 
 
 		 337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  60 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  53.15 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  51.89 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  47.54 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  49.17 
 
 		 124 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  54.21 
 
 		 170 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  55.56 
 
 		 254 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  63.74 
 
 		 200 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  62.22 
 
 		 140 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 278 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  34.01 
 
 		 424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  60.87 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  56.57 
 
 		 283 aa  116  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  58.51 
 
 		 181 aa  117  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  58.51 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 282 aa  116  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  54.46 
 
 		 381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  51.89 
 
 		 314 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  61.11 
 
 		 408 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  58.51 
 
 		 342 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  60.87 
 
 		 162 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  62.64 
 
 		 200 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  58.51 
 
 		 163 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  32.19 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  55.43 
 
 		 142 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  59.34 
 
 		 211 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  53.54 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  43.24 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 		 242 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  57.89 
 
 		 162 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  60.67 
 
 		 206 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  53.54 
 
 		 315 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  56.84 
 
 		 165 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  58.7 
 
 		 212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  60.67 
 
 		 206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 		 242 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  55.06 
 
 		 277 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 		 230 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  55.06 
 
 		 277 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 		 211 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  55.06 
 
 		 277 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 		 211 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  56.12 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  58.24 
 
 		 211 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  51.82 
 
 		 168 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 269 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  56.12 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  56.18 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  55.06 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  54.64 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  53.54 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  46.4 
 
 		 270 aa  113  5e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 202 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  55.06 
 
 		 277 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  53.26 
 
 		 266 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  53.26 
 
 		 275 aa  113  6e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  60.22 
 
 		 139 aa  113  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  53.26 
 
 		 275 aa  113  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  56.04 
 
 		 239 aa  113  6e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  43.85 
 
 		 286 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  47.4 
 
 		 249 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  55.43 
 
 		 267 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  48.6 
 
 		 293 aa  112  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 238 aa  112  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  56.18 
 
 		 280 aa  112  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  56.18 
 
 		 280 aa  112  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  56.18 
 
 		 280 aa  112  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  52 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  55.43 
 
 		 214 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  58.24 
 
 		 273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  58.24 
 
 		 273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 203 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  46.85 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>